Bio Technical フォーラム

  • バイオ関連の実験をする上での、試薬、機器、プロトコールなどの情報交換の場です。
  • 新しいテーマで話を始める場合、質問をする場合は「新しいトピックを作る」から書き込みをしてください。
  • 質問に対して解答できる方は是非、書き込んで下さい。
  • このフォーラムにふさわしくないと管理人が判断した投稿は予告なく削除します。

トピック一覧 | 研究留学ネットに戻る

最新のフォーラム | このフォーラム | ひとつ前のフォーラム(readのみ)

このスレッドをはてなブックマークに追加このスレッドをはてなブックマークに追加

ChIPのreverse crosslinkingについて トピック削除
No.848-TOPIC - 2011/08/30 (火) 14:06:17 - 素人です
ChIPのことでぜひとも教えていただきたいことがあります。
以前のプロトコールでは
IP後のビーズをhigh salt Bufferなどで5回ほどwashした後
elution Bufferでeluteしてから
高Naで6時間ほど反応させreverse crosslinkingし
そのあとproKで蛋白消化する手法だったと思います。
ところが
磁器ビーズの最近のプロトコールを読むと
IP後のビーズをwashした後
eluteせずにビーズごと
revers crosslinking bufferとProKで反応させ
DNAを回収する方法のようです。
(UpstateのMagna ChIPやinvitrogenのMagnify)
なるほどと思いながらも
これまで前者でやってきたので
後者でうまくいくか不安です。
やったことがある方いらっしゃいましたら
感想など聞けると嬉しいです。
 
- このトピックにメッセージを投稿する -



2件 ( 1 〜 2 )  前 | 次  1/ 1. /1


脱架橋は必要なし 削除/引用
No.848-2 - 2011/08/31 (水) 13:06:08 - ナデシコ組
IPしたらビーズを鋳型にPCRすればよろしい。

税金つかってるんだから、研究に素人も玄人も関係ない。
あり/なしで半分ずつ試せば数時間で結果がでるような内容を人に聞いて何の得があるの?

ChIPのreverse crosslinkingについて 削除/引用
No.848-1 - 2011/08/30 (火) 14:06:17 - 素人です
ChIPのことでぜひとも教えていただきたいことがあります。
以前のプロトコールでは
IP後のビーズをhigh salt Bufferなどで5回ほどwashした後
elution Bufferでeluteしてから
高Naで6時間ほど反応させreverse crosslinkingし
そのあとproKで蛋白消化する手法だったと思います。
ところが
磁器ビーズの最近のプロトコールを読むと
IP後のビーズをwashした後
eluteせずにビーズごと
revers crosslinking bufferとProKで反応させ
DNAを回収する方法のようです。
(UpstateのMagna ChIPやinvitrogenのMagnify)
なるほどと思いながらも
これまで前者でやってきたので
後者でうまくいくか不安です。
やったことがある方いらっしゃいましたら
感想など聞けると嬉しいです。

2件 ( 1 〜 2 )  前 | 次  1/ 1. /1


パスワードを入力してチェックした記事を チェックした記事を

このトピックにメッセージを投稿する
名前 
メール   アドレス非公開
   タイトル 
本文      
設定  クッキーを保存(次回の入力の手間を省けます)
上に上げない(トピックの一覧で一番上に移動させません)
解決(問題が解決した際にチェックしてください)
暗証  半角英数字8-12文字の暗証番号を入れると、あとで削除、修正ができます。
送信 

〔使い方〕
  • 「アドレス非公開」をチェックすれば、自分のメールアドレスを公開しないで他の方からメールを受け取れます。
  • 問題が解決した際には、解決ボタンをチェックして解決した旨のコメントをつけてください。これは、初めにトピックを作った人と管理人のみが可能です。
  • 半角カタカナ、機種依存文字(全角ローマ数字、○の中の数字等)は文字化けの原因となりますので使わないでください。