BioTechnicalフォーラム [細胞からのゲノム抽出]

細胞からのゲノム抽出

No.835-TOPIC - 2011/08/26 (金) 11:49:51 - 細胞よりのゲノム

すいません。まったくの素人です。
今、細胞を溶解して、そこからゲノムを取ってこようと思っています
いろいろと論文を読んでいると、界面活性剤、proteinaseK サポニン　etcと論文によって濃度も違えば、サポニンが入っていたり、入っていなかったりとどの論文も微妙に違います

私は、ヒストンも除去したゲノムを取ってきたいのですが、そのために最低限必要な試薬は何でしょうか？

もちろん、濃度は自身で検討したいと思います
　

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御礼

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No.835-6 - 2011/08/29 (月) 16:23:33 - 細胞よりのゲノム

皆様

ありがとうございました
もう少し自分で勉強してみます

(無題)

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No.835-5 - 2011/08/26 (金) 17:43:16 - ~

生徒さんの夏休みの自由研究かと思っていたのですが、大学生で系の開発を行なっている方でしたか。

>もちろん、濃度は自身で検討したいと思います
必要な試薬も、もちろん検討すべきでは。
すでに、市販されているキットの情報、公表されている論文・特許は集め始めているのですよね？
まずは、原理を考えつつ、それらの最小公約数となる試薬で出来るかどうかから検討されてはいかがでしょうか。

>論文によって使用している試薬やその濃度がまちまちでして
工学部であれば、デザインスペースの話は聞いたことがあるのでは？
濃度が異なることはおかしなことではないでしょう。

(無題)

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No.835-4 - 2011/08/26 (金) 17:00:12 - みむら

何と言いますか・・・

キットの改良を目指した研究を行なうつもりの方が、
実際の操作やそのときに使われる薬剤について

よくわからないとか、最低限の試薬とか
ここで聞いていることにかなり違和感を覚えるのは
私だけでしょうか？

＞いろいろと論文を読んでいると、界面活性剤、proteinaseK サポニン　etcと論文によって濃度も違えば、サポニンが入っていたり、入っていなかったりとどの論文も微妙に違います

それぞれ、何を狙って加えてあるのか、加えたものはどういう作用があるものなのか？

それ理解しないのに、どうして改良などできましょうか。

(無題)

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No.835-3 - 2011/08/26 (金) 16:41:47 - 細胞よりのゲノム

早速のご返答ありがとうございます

私は工学部に所属していまして、経験不足のものです
材料は培養細胞でそこから細胞を溶解し、ゲノム（ＤＮＡ）を取ってきたいと思います
ご指摘のとおり、キットを使用すれば解決するのですが、我々はそのキットの改良を目指した研究を行なっています。溶解部分の試薬は論文と同一となりますが、抽出してくる過程に工夫をしたいと思っております

そのために、細胞を溶解させ、ヒストンの結合していない状態でＤＮＡにできる試薬の条件を探しているのですが、論文によって使用している試薬やその濃度がまちまちでして、この掲示板でご意見をいただければと思っておりました

(無題)

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No.835-2 - 2011/08/26 (金) 13:09:40 - ~

貴方の所属は何で、材料は何で、使える機器は何で、
そのゲノムDNAに求められる純度はどのようなもので、使用目的は何でしょうか。

また、書かれている最低限というのはどのくらい重要なのでしょうか？
キットを買ったり、実験書に書かれている試薬を一通り揃えるのは嫌という意味なのでしょうか？
それとも、家庭にあるもの（中性洗剤など）で実験してみたいという意味なのでしょうか？

細胞からのゲノム抽出

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No.835-1 - 2011/08/26 (金) 11:49:51 - 細胞よりのゲノム

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