Bio Technical フォーラム

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最小の機能ドメイン トピック削除
No.750-TOPIC - 2011/08/03 (水) 18:58:53 - NS
お世話になります。

4-Oxalocrotonate tautomerase (EC 5.3.2.-4-OT) という60残基程度の酵素タンパク質があるようなのですが、これよりも残基数が少なく、それ単独で(単量体として)機能的で、きちんと折り畳まれた三次元構造をとるタンパク質(やドメイン)をご存知ないでしょうか?

ここでいう機能的というのは酵素活性を持つもの、あるいは特定の低分子リガンド(金属イオンは除く)を特異的に結合できるもの、です。

よろしくご教示願います。
 
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(無題) 削除/引用
No.750-3 - 2011/08/04 (木) 08:12:52 - NS
>yyy様

有益な情報を有り難うございます。

(無題) 削除/引用
No.750-2 - 2011/08/03 (水) 23:27:39 - yyy
特定の低分子リガンドと言うのが生理的なものでなくて良いのなら
tetracysteine motif (-CCPGCC-)が6残基で最小のような気がします。
ヘアピン構造を取り、biarsenical fluorophoreを特異的に結合します。

最小の機能ドメイン 削除/引用
No.750-1 - 2011/08/03 (水) 18:58:53 - NS
お世話になります。

4-Oxalocrotonate tautomerase (EC 5.3.2.-4-OT) という60残基程度の酵素タンパク質があるようなのですが、これよりも残基数が少なく、それ単独で(単量体として)機能的で、きちんと折り畳まれた三次元構造をとるタンパク質(やドメイン)をご存知ないでしょうか?

ここでいう機能的というのは酵素活性を持つもの、あるいは特定の低分子リガンド(金属イオンは除く)を特異的に結合できるもの、です。

よろしくご教示願います。

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