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(無題) 削除/引用 No.75-7 - 2011/03/04 (金) 12:13:18 - Sh 論文、見つかりました。 皆さん、ありがとうございました。

(無題) 削除/引用 No.75-6 - 2011/02/28 (月) 12:48:56 - Sh in situさん。ありがとうござういます。 今回の実験では、同一細胞由来の同じtotal RNAを利用して、二つの分子の発現量比較をしたいと考えているので、内部標準は使っておりません。例えば1ng total RNA中のコピー数として表せるかなと思っておりました。ただ、スタンダードとしてplasmidのコピー数を利用しており、この辺りもつっこまれるポイントの可能性があると思っております。

(無題) 削除/引用 No.75-5 - 2011/02/28 (月) 11:55:15 - in situ RNAのコピー数を求める実験をしていました。 ただ、結構大変で、in vitro transcriptionで人工合成したRNAをスタンダードに用いて逆転写反応からサンプルと一緒に行い、検量線を描いてコピー数を算出します。 たぶんこのようなことをやっている論文はあまりないです。 というのは、通常、qPCRはinternal controlで補正をかけますから絶対的なコピー数を求めても意味がないからです。 スレ主さんの場合、internal controlは取っていないのでしょうか？

(無題) 削除/引用 No.75-4 - 2011/02/28 (月) 11:40:27 - Sh ンンノさん。Boston-Pullmanさん。ありがとうございます。 google imageでは調べていたのですが、調べたモノの多くが、relative copy numberで片方を１にしている論文が多いのですね。コピー数が載っている論文は、ゲノムを利用したモノが多いようです。未だに、RNA中のコピー数の文献は見つけられておりません。やはりンンノさんがいわれるように、reviewerに計算式や結果について指摘させる可能性があるので、片方を１とするようにします。本当にありがとうございました。

(無題) 削除/引用 No.75-3 - 2011/02/27 (日) 04:55:45 - Boston-Pullman quantitative pcr copy number Google image search するといくつか論文のFigureがでてきます。参考になると思います。

(無題) 削除/引用 No.75-2 - 2011/02/26 (土) 19:35:03 - ンンノ プラスミド濃度の正確な測定は案外むつかしいので、何倍違うかという相対値 だけで結果を示すケースが多いように思いますね。 生物学的にはそれで十分な情報になるケースが多いですし、過剰解釈をして 査読の際に指摘されると困りますし。 ちゃんと実験してコピー数で結果を得られているなら、それを示すことに何も 問題はありません。

qPCRでコピー数 削除/引用 No.75-1 - 2011/02/26 (土) 11:26:09 - Sh 培養細胞中のtotal RNA内の分子Aと分子Bの発現量を、それぞれのプラスミドから得られたコピー数で相対比較したいと考えております。リアルタイムPCRの相対比較の時に、Y軸にコピー数で表示させている論文をご存知でしょうか。 いろいろと調べたのですが、うまく見つかりません。あまりこのような表示はしないものなのでしょうか。確かに相対比較なので、片方を1としてしまえば良いとも思うのですが、コピー数での表示を求められております。 よろしくお願いします。

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