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vectorの泳動について トピック削除
No.670-TOPIC - 2011/07/13 (水) 19:16:46 - sasa
現在clontech社のpAcGFP1-C1vectorを用いてクローニングを行っています。クローニングの課程で不振な点がありました。本来、上記のvectorは4.3kbなのですが、何度かクローニングを行い制限酵素処理などを行っていると約3kb付近にバンドが現れるようになりました。
サブクローニングやセレクションを何度がやり直し、チェックを掛けましたがどうにも原因が分からず、vectorの原液を電気泳動に掛けたところ、4.3kbと3kbに二つバンドが現れました。
今まで経験がないので分からないのですが、本来制限酵素処理を行わないvectorのみの泳動はシングルバンドが当然であると思い込んでいました。
試薬や器具のコンタミや不備等もチェックを行ったのですが、解決法が見当たりません。製品が不良品だと疑いを持ち始めたのですが、このような経験をお持ちの方がいらしゃいましたら、何かしらの意見を頂けると幸いです。
 
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(無題) 解決済み 削除/引用
No.670-4 - 2011/07/13 (水) 20:56:11 - sasa
ありがとうございました。

(無題) 削除/引用
No.670-3 - 2011/07/13 (水) 20:54:30 - sasa
お恥ずかしい、その通りだと思います。制限酵素処理後に泳動し、確認してみます。

ありがとうございました。

(無題) 削除/引用
No.670-2 - 2011/07/13 (水) 20:10:26 - PYK
スーパーコイルを形成したものでは?

vectorの泳動について 削除/引用
No.670-1 - 2011/07/13 (水) 19:16:46 - sasa
現在clontech社のpAcGFP1-C1vectorを用いてクローニングを行っています。クローニングの課程で不振な点がありました。本来、上記のvectorは4.3kbなのですが、何度かクローニングを行い制限酵素処理などを行っていると約3kb付近にバンドが現れるようになりました。
サブクローニングやセレクションを何度がやり直し、チェックを掛けましたがどうにも原因が分からず、vectorの原液を電気泳動に掛けたところ、4.3kbと3kbに二つバンドが現れました。
今まで経験がないので分からないのですが、本来制限酵素処理を行わないvectorのみの泳動はシングルバンドが当然であると思い込んでいました。
試薬や器具のコンタミや不備等もチェックを行ったのですが、解決法が見当たりません。製品が不良品だと疑いを持ち始めたのですが、このような経験をお持ちの方がいらしゃいましたら、何かしらの意見を頂けると幸いです。

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