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大腸菌へのtransformation トピック削除
No.600-TOPIC - 2011/06/30 (木) 12:36:41 - 初心者
いつも勉強をさせていただいております。

大腸菌へのトランスフォーメーションで、困っています。

単一のvectorをエレクロトポーレションで形質転換し、
出てきたコロニーを調べると、大きさが変わってしまったり、
制限酵素処理で、違うパターンが出たりします。
元のvectorの確率は、10個中1個位しかありません。

形質転換に使ったvectorは単一と考えると、
何か大腸菌内で起こることはあるのでしょうか?
同じような事が起こって、解決された方がいらっしゃれば、
ご教授いただければと思います。
 
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(無題) 削除/引用
No.600-5 - 2011/06/30 (木) 14:23:06 - 初心者
~さん

どうもありがとうございます。勉強になります。

vectorや大腸菌は、少し特殊なものを使っております。
なので、少し条件検討が必要なのかもしれません。
とりあえず、大腸菌を変えて行なってみたいと思います。

(無題) 削除/引用
No.600-4 - 2011/06/30 (木) 14:10:51 - ~
>vectorを大腸菌で増やす時に、こんなに頻繁に組換えがおこるのでしょうか?
起きるものは1個も取れないほど組換えが生じることがあります。
取れている10個中1個の元のベクターも、もう1回増やしたら削れるかもしれません。

>もしリコンビネーションが起こってしまうとしたら、何か解決策等ありますか?
菌株を選んだり、培養温度を下げることで抑制できる場合があります。

ただ、前提として
>大腸菌や培養温度などは確認し
ということは、そのあたりの条件に問題が無いはずです。
その確認した相手は、そのベクターを増やしたことのある人なのですか?
経験は無く、これで増やせるはずだと言っているのであれば、間違っている可能性もあります。
また、温度のみで対応しているときには、何故か人によって削れたり削れなかったりすることはありました。
その場合は大腸菌株を変えることで、誰でも増やせるようになりました。

差し支えなければ、ベクター名や使用している大腸菌株名の情報をここにあげれば、もっと情報が得られるかもしれません。

(無題) 削除/引用
No.600-3 - 2011/06/30 (木) 13:28:32 - 初心者
~さん

早速の返事ありがとうございます。

大腸菌や培養温度などは確認し、30℃で培養を行なっています。

もしリコンビネーションが起こってしまうとしたら、何か解決策等ありますか?
大腸菌を変えるとかでしょうか。

基本的な質問で大変恐縮なのですが、vectorを大腸菌で増やす時に、こんなに頻繁に組換えがおこるのでしょうか?以前に6 kbp位のplasmidを増やしたときには、こんなことは起こらなかったので、困っています。

(無題) 削除/引用
No.600-2 - 2011/06/30 (木) 13:16:52 - ~
>何か大腸菌内で起こることはあるのでしょうか?
リコンビネーション。

まずは、そのベクターの入手元に、そのベクターの増やし方を確認しましょう。
増やすことの出来る大腸菌株が指定されていたり、培養温度が指定されていることがあります。

大腸菌へのtransformation 削除/引用
No.600-1 - 2011/06/30 (木) 12:36:41 - 初心者
いつも勉強をさせていただいております。

大腸菌へのトランスフォーメーションで、困っています。

単一のvectorをエレクロトポーレションで形質転換し、
出てきたコロニーを調べると、大きさが変わってしまったり、
制限酵素処理で、違うパターンが出たりします。
元のvectorの確率は、10個中1個位しかありません。

形質転換に使ったvectorは単一と考えると、
何か大腸菌内で起こることはあるのでしょうか?
同じような事が起こって、解決された方がいらっしゃれば、
ご教授いただければと思います。

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