Bio Technical フォーラム

  • バイオ関連の実験をする上での、試薬、機器、プロトコールなどの情報交換の場です。
  • 新しいテーマで話を始める場合、質問をする場合は「新しいトピックを作る」から書き込みをしてください。
  • 質問に対して解答できる方は是非、書き込んで下さい。
  • このフォーラムにふさわしくないと管理人が判断した投稿は予告なく削除します。

トピック一覧 | 研究留学ネットに戻る

最新のフォーラム | このフォーラム | ひとつ前のフォーラム(readのみ)

このスレッドをはてなブックマークに追加このスレッドをはてなブックマークに追加

制限酵素処理後の精製について トピック削除
No.564-TOPIC - 2011/06/23 (木) 09:08:47 - コンタミ
お世話になっています。

現在、54 bpの核酸を制限酵素処理し、精製キットを用いて精製しようとしています。キットはRocheのHigh Pure PCR Cleanup Micro Kit(50 bp〜5 kbpの核酸に最適)を用いており、このキットを用いて3度試した結果、精製後にバンドが認められませんでした。精製前の濃度としては50 ng/uLでした。エタ沈も考慮していますが、教授の意向で低bp核酸に適した精製キットを探しています。何か適したキットや他の案などありましたら、教えて頂ければ幸いです。宜しくお願い致します。
 
- このトピックにメッセージを投稿する -



4件 ( 1 〜 4 )  前 | 次  1/ 1. /1


(無題) 削除/引用
No.564-4 - 2011/06/23 (木) 18:33:42 - 310
50bp前後の精製にMermaid kitを使っています。MPbioという会社ですが、私は米国にいるため、日本の取扱店は分かりません、しかし18年程前に日本でも同じキットの名前を聞いているため、入手は可能と思います。

ちなみに溶液のひとつが、蓋の閉めが甘かったためか、少しもれ、殆ど蒸発してやってきました。ほぼ目分量で析出した塩を溶かしてアルコールを加え使っています。そのためかどうか分かりませんが、回収率は5-6割程度です。

(無題) 削除/引用
No.564-3 - 2011/06/23 (木) 16:47:25 - 774
shRNAとかですかね?
目的はさておき、制限酵素処理した後にフェノクロ・エタ沈してライゲーションしてしまえばいいんじゃないでしょうか?
DNA濃度は気にしなくても何とかなる気がします。
インサートの方は少々切れ残りがあってもそんなに問題にならないでしょうし。

(無題) 削除/引用
No.564-2 - 2011/06/23 (木) 10:46:20 - ops
54 bpのDNAを制限酵素処理した後に、なにかベクターに入れたいだけでしたら、
末端が制限酵素処理後の配列になるようにDNAオリゴを設計し、DNA合成は外注して、
アニーリングさせて、リン酸化して、ライゲーションでしょうか。
(得られたプラスミドの、シークエンス確認は必須ですが。)

私でしたら、途中で分けて、合計4つのオリゴで作りますかね。

何度がこのフォーラムでも出てきているとは思います。。

制限酵素処理後の精製について 削除/引用
No.564-1 - 2011/06/23 (木) 09:08:47 - コンタミ
お世話になっています。

現在、54 bpの核酸を制限酵素処理し、精製キットを用いて精製しようとしています。キットはRocheのHigh Pure PCR Cleanup Micro Kit(50 bp〜5 kbpの核酸に最適)を用いており、このキットを用いて3度試した結果、精製後にバンドが認められませんでした。精製前の濃度としては50 ng/uLでした。エタ沈も考慮していますが、教授の意向で低bp核酸に適した精製キットを探しています。何か適したキットや他の案などありましたら、教えて頂ければ幸いです。宜しくお願い致します。

4件 ( 1 〜 4 )  前 | 次  1/ 1. /1


パスワードを入力してチェックした記事を チェックした記事を

このトピックにメッセージを投稿する
名前 
メール   アドレス非公開
   タイトル 
本文      
設定  クッキーを保存(次回の入力の手間を省けます)
上に上げない(トピックの一覧で一番上に移動させません)
解決(問題が解決した際にチェックしてください)
暗証  半角英数字8-12文字の暗証番号を入れると、あとで削除、修正ができます。
送信 

〔使い方〕
  • 「アドレス非公開」をチェックすれば、自分のメールアドレスを公開しないで他の方からメールを受け取れます。
  • 問題が解決した際には、解決ボタンをチェックして解決した旨のコメントをつけてください。これは、初めにトピックを作った人と管理人のみが可能です。
  • 半角カタカナ、機種依存文字(全角ローマ数字、○の中の数字等)は文字化けの原因となりますので使わないでください。