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タンパク質の脱リン酸化処理について トピック削除
No.56-TOPIC - 2011/02/22 (火) 11:35:20 - phos
　
タンパク質の脱リン酸化処理として

phosphatase処理

フッ化水素酸-70％ピリジン酸

飽和水酸化バリウム

などの方法は見つけたのですが
ほかに脱リン酸化処理はありますでしょうか？

よろしくお願いします。

追記：
タンパク質を脱リン酸化処理してから2-Dにかけるつもりです。
　
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(無題) 削除/引用
No.56-4 - 2011/02/23 (水) 14:28:25 - Boston-Pullman
SDSはサンプルの入りが良くなるのでむしろ積極的に使っていました。泳動中にSDSはたんぱく質から解離するので、等電点電気泳動の邪魔はしません。

でも今は自分で１次元のゲルなんて作らないのでしょうね。サンプルに浸してゲルを膨潤させるのでSDSは必要ないかもしれません。

返信ありがとうございます 削除/引用
No.56-3 - 2011/02/23 (水) 13:03:40 - phos
BAP処理とはE.coli Alkaline phosphatase
ですよね。

BAP処理とCalf Intestine Alkaline Phosphatase
ではBAP処理のほうが脱リンの効果は高いのでしょうか？

SDS存在下で60度ということでしたが
その処理では2D-PAGEにはかけられないと思うのですが…。

(無題) 削除/引用
No.56-2 - 2011/02/22 (火) 21:49:05 - PI
SDSの存在下で60度とかでBAP処理すれば、ほとんどリン酸は外れるんじゃないでしょうか。また２Dだと、リン酸がついてても、大体バンドはシフトして、脱リン酸化型とリン酸付きのスポットが異なる等電点スポットになって、それらしいパターンになるので、そこまで神経質になる必要はないような気がします。chemicalなやり方は初めて聞きました。HFもBaOHもポリペプチド鎖で切れることもあるんじゃないですかね。

タンパク質の脱リン酸化処理について 削除/引用
No.56-1 - 2011/02/22 (火) 11:35:20 - phos
　
タンパク質の脱リン酸化処理として

phosphatase処理

フッ化水素酸-70％ピリジン酸

飽和水酸化バリウム

などの方法は見つけたのですが
ほかに脱リン酸化処理はありますでしょうか？

よろしくお願いします。

追記：
タンパク質を脱リン酸化処理してから2-Dにかけるつもりです。
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