みなさま
おめでとうございます。今年もどうぞよろしくお願い致します。
私どもの実験において、ある低分子化合物と蛋白質との結合様式をmolecular operating environment (MOE)を利用して予測いたしました。
私は生化学的にその２つの分子が結合することを示した担当なのですが、docking simulationは共同研究先の先生にお願いして行っていただいたものです。
今回、結合様式を3Dだけでなく、2Dでも示したいと考えております。
http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0223523409004619
上の論文のFig.3のデータを共同研究先の先生よりいただきましたが、このfigure legendを今のうちに書いておこうと考えておりますが、上記論文でのfigure legendでは「Fig. 3. 2D interaction of compound 21 with PIM1 kinase.」としか書かれてありません。
これでは不十分というわけではないのですが、相互作用に与るアミノ酸をハイライトさせるなど同じような2-D figureを作製されてる論文がありましたらご紹介いただけないでしょうか？
まず、このfigureを作製するためにどんなソフトを使用したかも分からないので、論文の調べ方などもわかりませんでした。
今、共同研究先の先生は、お正月休みを取られておりますので、その間にlegendだけでも書いておきたいと考えております。どうかみなさま豊富な経験からアドバイスをいただけますと幸甚です。
どうぞよろしくお願い申し上げます。 |
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