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リボヌクレアーゼA処理
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No.1224-TOPIC - 2011/11/17 (木) 07:38:01 - A
アルカリSDS法についての質問です。
現在ラボにはリボヌクレアーゼAがありません。
そこで, アルカリSDS法のプロトコールからリボヌクレアーゼA処理
を省略した場合, 目的遺伝子発現ベクターの構築に何か影響が出る
でしょうか。ご回答お待ちしています。
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(無題)
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No.1224-11 - 2011/11/26 (土) 20:34:39 -
月詠
RNAを取り扱う際には、手袋とマスクを着用するよう教わりますよね
理由は、汗や唾の中にはRNaseが多量に含まれていて、それらが混入すると
サンプル中のRNAをロスしてしまうからですよね
ですので、RNaseがないときには、唾か汗でも混ぜておけば解決です(嘘
というのは冗談で…市販されている多くのプラスミドDNA抽出キットは、
基本的にはアルカリSDS法を元に構築されていると思います
(溶菌からカラムに通す前までの前半部分)
ですので、遠心で回収した菌を懸濁する最初の溶液(solution I相当)に
添加するRNaseA溶液も付属している(もしくは最初から添加済)と思います
過去に類似のスレッドがありましたのでご参照まで
http://www.kenkyuu2.net/cgi-biotech2011/biotechforum.cgi?mode=view;Code=272
DNAは吸着するけどRNAは吸着しないようカラムが改良進化していれば
RNase処理は不要ですので、最近のキットには添付されてないかもしれません…
ちなみにわたしも学生のときにアルカリSDS法を最初に教わりましたけど、
RNase無添加で抽出した場合、約500bpより下に、かなりの量のブロードな
バンドが出現し、RNase処理によってそれらは完全に消失しました
「RNAはとにかく分解しやすいから手袋とマスク着用は当たり前」
のように教わりますけど、そのときは手袋もしないで抽出操作をしていましたので、
注意深く操作しさえすれば、RNAだからといって(わざわざ手袋までしなくても)
簡単にはロスしないものだと、わたしは思っています
(無題)
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No.1224-10 - 2011/11/22 (火) 09:51:20 - TOPP
>>余ったキットの試薬はアルカリSDS法に使用できます。
出来そうだなとは思っていましたが, やはり出来るのですね。
一度試してみたいと思います。
(無題)
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No.1224-9 - 2011/11/21 (月) 13:28:12 - ああああ
キットにRNaseAは入ってると思います。
キットもカラムを通すまでは、アルカリSDS法とほぼ同じです。カラムを通さないでエタ沈するのが、マニュアルのアルカリSDS法です。
なので、余ったキットの試薬はアルカリSDS法に使用できます。
遅れました
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No.1224-8 - 2011/11/18 (金) 21:12:48 - A
みなさん感謝します。
うちのラボではキットを使ったミニプレップを基本としており, アルカリSDS法
の知識がない人ばかりです。他大学に進学するに当たり, アルカリSDS法を初め
とする基本的な操作テクニックを身につけたいと思い, ラボを探しましたが
RNaseAはありませんでした。そこで質問してみた次第です。意見をまとめると
何か影響が出そうな感じもしますので(用途はバックボーンベクター), やめて
おく事にします。ありがとう御座いました。
(無題)
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No.1224-7 - 2011/11/18 (金) 09:53:38 - 老害
元々の方法(Nuc Acid Res vol 7 p1513) では、RNaseAを加えてはいません。大昔はこの方法でやっていました。RNAが混入してくることを除けばプラスミドの抽出自体には影響はでません。
(無題)
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No.1224-5 - 2011/11/17 (木) 18:35:41 - KY
500bp以上のプラスミド断片を切り貼りするのであれば、できるとは思います。
購入は?
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No.1224-4 - 2011/11/17 (木) 18:22:39 - ema
無いならないですが、RNaseAの購入予定はないのでしょうか?
私は目的のplasmid回収であたりではアルカリ法で取ってカットチェック等しますが、つなぎ直し、細胞へのTransfectなど実験方向のものはカラム(RNAse処理)で行います。
(無題)
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No.1224-3 - 2011/11/17 (木) 08:03:46 -
Harmonia
影響が出ないとは言い切れません。
プラスミドプレップのあと、何がやりたいかによります。
「制限酵素処理をして電気泳動したけど、RNAも見えるので、500 bp の断片があるのかないのか分からない」
ということも有るし、
「ある反応をさせたけど、RNA が阻害剤になってしまって、反応が進まない」
ということも有るでしょう。
(無題)
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No.1224-2 - 2011/11/17 (木) 07:51:19 - モモ
RNaseAがないっていったい・・・
リボヌクレアーゼA処理
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No.1224-1 - 2011/11/17 (木) 07:38:01 - A
アルカリSDS法についての質問です。
現在ラボにはリボヌクレアーゼAがありません。
そこで, アルカリSDS法のプロトコールからリボヌクレアーゼA処理
を省略した場合, 目的遺伝子発現ベクターの構築に何か影響が出る
でしょうか。ご回答お待ちしています。
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