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Wound assayの統計処理 トピック削除
No.1019-TOPIC - 2011/10/06 (木) 00:21:18 - Wound assay
すみませんが教えてください。
6種類の細胞株それぞれに遺伝子をトランスフェクションし
Wound assay を行いました。
それぞれの細胞株について時間経過とwoundの幅についてのグラフを作る事はできましたが
統計学的に遺伝子をトランスフェクションしたものでは
Healing が遅延することを示したいのです。

どういった方法が良いのか分かりません。
ご存知の方が何卒よろしくお願いしします
 
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追加 削除/引用
No.1019-6 - 2011/10/07 (金) 21:17:20 - ハルナ

ごめんなさい,追記です.

前の書き込みで,


「時間経過とwoundの幅についてのグラフから傾きか何かwound healingの速度をあらわすようなものを計算し、それの平均、標準偏差などを求めて、検定をおこなう、と言うのはどうでしょうか。」

というのがありましたが,二元配置も基本的には似たようなことだと理解してます.

縦軸にwoundの幅,横軸に時間経過をとって,細胞ごとに(つまり6本の)回帰直線がひけるのであれば,それらの傾きや切片の大きさを検定することは共分散分析できるとおもいますよ.

ただ6個すべての組み合わせで検定するとなると,p値の補正が結構たいへんで差がまったく検出されない,という気もします.

二元配置かなあ 削除/引用
No.1019-5 - 2011/10/07 (金) 21:07:53 - ハルナ
woundの幅がいったいどのようなデータなのか私わからないので恐縮ですが,


要因1:細胞の種類(6種,水準=6)
要因2:測定時間(記載なし,水準=?)

の2つの要因で「woundの幅」を計測してるのなら,
二元配置の分散分析でいける気がしますが,どうでしょうか.

(無題) 削除/引用
No.1019-4 - 2011/10/07 (金) 09:58:42 - TS
実験のテクニカルな部分は別にして、
数値が出ているのであれば、統計処理は普通にかけられると思いますが。

どのあたりに疑問を持っておられるのでしょう。

やったことがないですが、 削除/引用
No.1019-3 - 2011/10/07 (金) 07:24:12 - w
思いついた事だけ書かせてもらいます。
時間経過とwoundの幅についてのグラフから傾きか何かwound healingの速度をあらわすようなものを計算し、それの平均、標準偏差などを求めて、検定をおこなう、と言うのはどうでしょうか。

(無題) 削除/引用
No.1019-2 - 2011/10/06 (木) 23:01:00 - qq
うまく行くのですか?
大変高いトランスフェクション効率と、トランスフェクションからヒーリングアッセイまでの遺伝子発現が維持される必要がありそうですが、どうなんでしょう。
と、質問で切り返しちゃあいけないんだけど、興味アリ。
それとも、安定発現株ですか。

Wound assayの統計処理 削除/引用
No.1019-1 - 2011/10/06 (木) 00:21:18 - Wound assay
すみませんが教えてください。
6種類の細胞株それぞれに遺伝子をトランスフェクションし
Wound assay を行いました。
それぞれの細胞株について時間経過とwoundの幅についてのグラフを作る事はできましたが
統計学的に遺伝子をトランスフェクションしたものでは
Healing が遅延することを示したいのです。

どういった方法が良いのか分かりません。
ご存知の方が何卒よろしくお願いしします

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