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phosphomimetic vectorについて トピック削除
No.38-TOPIC - 2007/08/07 (火) 06:43:26 - リン酸化
どうも、いつも有益なtopicありがとうございます。

リン酸化の実験において、phosphomimetic vectorを作成すると思います。
一般的には、Thr,SerをDやEにして(T or S to D or E)作成すると思います。
今回T to Dを作成して実験をしたのですが、あまりはっきりとした変化が出ず、
どちらかというと、T to A vectorと同じような結果となりました。このような時、T to Eを作成したり、何らかの方法(つまりphosphomimetic conditonになるように)はあるのでしょうか?もし何らかの経験や、解決方法などおありでしたらよろしくお願いします。
 
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(無題) 削除/引用
No.38-3 - 2007/08/07 (火) 10:51:00 - SQ/TQ
 確かにDでだめなら、Eに変えるという策もありますが、
DやEが完全にリン酸化をミミックしている訳ではない
(電荷や、側鎖の大きさは似ていますが、完全に同じではない)
ので、アミノ酸置換によるミミックは、
いつもうまくいくわけではないと思われます。

 リン酸化さんの場合には、Tの修飾がリン酸基であることが
非常に重要なので、DEではAと同じような挙動に
なってしまったのかもしれません。

 リン酸化の起きやすい条件でT体とA体を比較するなど
するのがいいのかもしれませんね。

(無題) 削除/引用
No.38-2 - 2007/08/07 (火) 10:43:45 - 奴隷
TtoDがダメだった場合でも、TtoEを試してみる価値はあると思います。DとEのどちらが有効かはケース・バイ・ケースで、予想できるようなものではないというのが実感です。

phosphomimetic vectorについて 削除/引用
No.38-1 - 2007/08/07 (火) 06:43:26 - リン酸化
どうも、いつも有益なtopicありがとうございます。

リン酸化の実験において、phosphomimetic vectorを作成すると思います。
一般的には、Thr,SerをDやEにして(T or S to D or E)作成すると思います。
今回T to Dを作成して実験をしたのですが、あまりはっきりとした変化が出ず、
どちらかというと、T to A vectorと同じような結果となりました。このような時、T to Eを作成したり、何らかの方法(つまりphosphomimetic conditonになるように)はあるのでしょうか?もし何らかの経験や、解決方法などおありでしたらよろしくお願いします。

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