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probe(プローブ)がハイブリするか確認する方法 トピック削除
No.2655-TOPIC - 2009/01/15 (木) 11:05:10 - 佐山あやこ
ある細菌のシークエンスデータがあります。
その細菌にprobeXがきちんとハイブリするかチェックする方法を
教えてください。
もちろんprobeXの塩基配列は分かっています。
 
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(無題) 削除/引用
No.2655-3 - 2009/01/15 (木) 13:01:29 - ~
>きちんとハイブリするか
どのような操作をしようとしているのか分かりませんが、
きちんとには、目的の配列と結合するかだけでなく、目的外の配列と結合しないか、または泳動で分離できるなども含まれていますよね。

実際にやってみて、ハイブリやwashの条件などまで検討しないと、
使い物になるかは分からないでしょう。

(無題) 削除/引用
No.2655-2 - 2009/01/15 (木) 12:33:28 - おお
細菌の何にはいぶりすることを望んでいるのですか、
ゲノム、RNAとか、、、

その細菌を使って、ハイブリを行えば分かると思うの
ですが、RNAならin vitroトランスクリプションを
するとか、手はあると思いますし、

あなたの考えている実験系に近い形のポジコン
でうまく働くか確認するのがいいのではと思いますが

probe(プローブ)がハイブリするか確認する方法 削除/引用
No.2655-1 - 2009/01/15 (木) 11:05:10 - 佐山あやこ
ある細菌のシークエンスデータがあります。
その細菌にprobeXがきちんとハイブリするかチェックする方法を
教えてください。
もちろんprobeXの塩基配列は分かっています。

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