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レンチウイルスのパッケージング トピック削除
No.2654-TOPIC - 2009/01/15 (木) 10:23:32 - gs86
レンチウイルスのパッケージングに必要なベクターについてお尋ねします。

通常は目的遺伝子を持ったウイルスベクター以外に、gag,pol,rev,envの4つの遺伝子が必要で、gag/pol, rev, VSVGの3つにパッケージング用ベクターが分けられている(市販のシステム等)と理解していたのですが、RNAi consortiumのプロトコールをみると(http://www.broad.mit.edu/genome_bio/trc/publicProtocols.html)、
パッケージング用にgag/pol, VSVGベクターのみ使用するように書いてあります。
このシステムは一般的な市販のシステムと違うのでしょうか?
あるいはrevタンパクがないとウイルスは複製できないと思っていたのですが、どこか間違っている点があればご指摘ください。
 
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(無題) 解決済み 削除/引用
No.2654-6 - 2009/01/15 (木) 23:03:35 - gs86
皆さん早速ありがとうございました。

ちゃんと書いてありましたね、見落としていました。
お恥ずかしい、、、、

施設等の条件については確認します。
ウイルスは最近勉強し始めたばかりでしたので、
大変参考になりました。

ありがとございました。

(無題) 削除/引用
No.2654-5 - 2009/01/15 (木) 11:58:02 - 〜
今はどうかはしりませんが、第2世代は確かP3の施設が必要だったと記憶しています。
そのあたりがクリアーされていれば問題ないですが、でなければ第3世代のほうが無難でしょう。
でも確かに明らかに titerは落ちますね。
間違っていたらすみません。

(無題) 削除/引用
No.2654-4 - 2009/01/15 (木) 11:52:01 - 通りすがり
>gag/pol, rev, VSVGの3つにパッケージング用ベクターが分けられている

基本的にはレンチのシステムは現在2ndと3rd generationといわれる二つのシステムが主に使われており

大きな違いはパッケージングの部分で
2nd generationのがgag/pol/revが一つのvectorに入っており
3rd generationのがgag/pol と Revが別々のvectorに
分けられているという違いです。
いずれにしてもRevが無い限りほとんどのvirus RNAは不安定だったり輸送がうまくいかなくてパッケージングは激減(というかほぼない)します。

3rdのほうが安全性が高いとされていますが、その代わりTiterがはっきりいって低いです(市販されてるのは使用したことがないのでわかりませんが)。

>RNAi consortiumのプロトコールをみると(http://www.broad.mit.edu
>/genome_bio/trc/publicProtocols.html)、
>パッケージング用にgag/pol, VSVGベクターのみ使用するように書いてありま
>す。

いや、今見たらはっきり
>2nd generation packaging plasmid containing gag, pol and rev genes >(e.g. pCMV-dR8.91 or pCMV-dR8.74psPAX2)*

とgag/pol/Revと書いてますね。

ここで言ってるのは上記の2nd generationのsystemのpackaging plasmidであるpCMV-dR8.91やpCMV-dR8.74あるいはpsPAX2を
使いなさいということです。

これらは全部gag/pol/Revを持ってるので
どれでもお使いの3rd generationのgag/polおよびrevの二つのvectorの役割を
一つで果たしてくれます。

要するに市販されてるあなたのお持ちの
3rdの
>gag/pol, rev, VSVGの3つにパッケージング用ベクター
でも、一応できはするはずですが、

たぶんわざわざ2ndのを使えと書いてるのは
3rdでもできますがtiterが低くてうまくいかないかもしれないよ、ということでしょう。


ちなみにこれら(pCMV-dR8.74〜psPax2)の違いはpromoterとかの違いで
現在一番titerが高いとされてるのはpsPax2ですし、自分も薦めます。
現在はaddgeneにdepositされてるので誰でも簡単にもらえますよ。

(無題) 削除/引用
No.2654-3 - 2009/01/15 (木) 10:43:25 - ?
2nd generation packaging plasmid containing gag, pol and rev genes (e.g. pCMV-dR8.91 or pCMVdR8.74psPAX2)*

(無題) 削除/引用
No.2654-2 - 2009/01/15 (木) 10:31:50 - gs86
> あるいはrevタンパクがないとウイルスは複製できないと思っていたのですが、どこか間違っている点があればご指摘ください。

すみません自己訂正です。
ウイルスは複製できない→ウイルスは産生されない
の書き間違いです。

レンチウイルスのパッケージング 削除/引用
No.2654-1 - 2009/01/15 (木) 10:23:32 - gs86
レンチウイルスのパッケージングに必要なベクターについてお尋ねします。

通常は目的遺伝子を持ったウイルスベクター以外に、gag,pol,rev,envの4つの遺伝子が必要で、gag/pol, rev, VSVGの3つにパッケージング用ベクターが分けられている(市販のシステム等)と理解していたのですが、RNAi consortiumのプロトコールをみると(http://www.broad.mit.edu/genome_bio/trc/publicProtocols.html)、
パッケージング用にgag/pol, VSVGベクターのみ使用するように書いてあります。
このシステムは一般的な市販のシステムと違うのでしょうか?
あるいはrevタンパクがないとウイルスは複製できないと思っていたのですが、どこか間違っている点があればご指摘ください。

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