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遺伝子記号がわかりません。 トピック削除
No.975-TOPIC - 2008/04/16 (水) 14:22:41 - mari
Lambdapirと書かれている大腸菌がありますが、どのような意味なのでしょうか?どなたかご存知の方教えて下さい。そういった説明のある本や、サイトご存知の方ぜひお願いします。
 
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lambda pir 削除/引用
No.975-8 - 2008/04/18 (金) 09:39:06 - EJ
あるのですね!
情報有り難うございます。
早速、あたってみます。
JMが良さそうかな。
S17-1って、此処で出てくるんだ。

実は、S17-1、感動の再会(とまではいかないか。)だったり。
蛇足ながらS17-1には思い出が。
某掲示板の質問トピで、この大腸菌のGenotypeが問題になった事が。
プラスミドを取っていて、何故かゲノムがコンタミする、って質問で。
で、この菌株は、どうやら大きなプラスミドを低コピー数保持した状態で使うらしい、と判って、それでそんな回答を書いたんでした。
MC1061/p3(最近ではTOP10/p3の方が使い易いかな)でSupFで拾うプラスミドを随分使っていたので、p3みたいなもんかな、がヒントでしたが。
もうお一方、同様の指摘をされた方も。
逆に、操作が悪くてゲノムが入るんでしょ!みたいな御方も。

いや、済みません、思い出話で。

Re:R6K oriを持つプラスミドを増幅させるには? 削除/引用
No.975-7 - 2008/04/18 (金) 00:23:15 - リソース
大腸菌なら、国立遺伝研のバイオリソースから入手できると思います。
http://www.shigen.nig.ac.jp/ecoli/strain/top/top.jsp

検索したところ、lambda pirを持つものは、3系統提供されてるみたいです。

R6K oriを持つプラスミドを増幅させるには? 削除/引用
No.975-6 - 2008/04/16 (水) 17:52:32 - EJ
便乗質問をお許し下さい。
R6K oriを持つプラスミドを増幅させるには、lambda pirで形質転換した大腸菌を使えば良い、と言う解釈で正しいようですが、ならば、そのような大腸菌は、市販されている、或いは何処かから容易に入手可能でしょうか?lambda pir 自体は、供与して貰わないとダメっぽいですが。
実は、PCRテンプレートでR6K oriベクターのプラスミド(に入った薬剤選択マーカーと、その真核細胞用及び原核細胞用プロモーターのカセット)、と言うのがあって、PCRはPhusionなどで問題なくかかるのですが、出来れば鋳型も増幅させておきたいのです。
もし、何方か御存知でしたら教えて頂けるでしょうか。

(無題) 削除/引用
No.975-5 - 2008/04/16 (水) 16:31:19 - mari
大変、勉強になりました!
Tさん、ありがとうございます!

(無題) 削除/引用
No.975-4 - 2008/04/16 (水) 16:16:10 - T
pMB1 ori は pBR322 などでも使われているもので、普通の遺伝子工学用大腸菌で増やせます。lambda pir を持っている必要はありません。

(無題) 削除/引用
No.975-3 - 2008/04/16 (水) 15:51:38 - mari
Tさんありがとうございます!
さらに質問なのですが、自分が使おうとしているベクター内にあるのがR6K oriではなく、pMB1 oriRというものなので、lambda pirの大腸菌は使う必要が無いということで、よろしいんですか?

(無題) 削除/引用
No.975-2 - 2008/04/16 (水) 14:41:22 - T
lambda pir で検索してみてください。

R6K ori を持つプラスミドを複製するためには、pi と呼ばれる蛋白が必要です。pi 蛋白をコードする遺伝子が pir で、これがラムダファージのベクター上に乗っているのが lambda pir です。このベクターで形質転換された大腸菌という事だと思います。

遺伝子記号がわかりません。 削除/引用
No.975-1 - 2008/04/16 (水) 14:22:41 - mari
Lambdapirと書かれている大腸菌がありますが、どのような意味なのでしょうか?どなたかご存知の方教えて下さい。そういった説明のある本や、サイトご存知の方ぜひお願いします。

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