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制限酵素AvaIについて トピック削除
No.947-TOPIC - 2008/04/11 (金) 01:57:43 - しつもん
NEBのカタログによるとAvaIはCYCGRGという配列を認識する制限酵素のようです。
CYCGRGというのは、CTCGAG/CCCGGGだけで、CTCGGG/CCCGAGは含まないのですか?
解析ソフトによっては、CTCGGGやCCCGAGも認識するのですが、どっちが正しいのでしょうか?
詳しい方がいたら教えて下さい。
 
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(無題) 削除/引用
No.947-4 - 2008/04/11 (金) 12:53:34 - L
パリンドロームではない配列を切る制限酵素もあったような気がします。
New England Biolabのリファレンスに乗っているハズです

(無題) 削除/引用
No.947-3 - 2008/04/11 (金) 05:56:46 - しつもん
>>銅鑼さん

早々の反応ありがとうございます。
実際に切れたらのなら、間違いないですね。
回文構造でないので、ちょっと心配でした。

(無題) 削除/引用
No.947-2 - 2008/04/11 (金) 04:35:13 - 銅鑼
AvaI、CTCGGG、認識します。
この前使いました。

制限酵素AvaIについて 削除/引用
No.947-1 - 2008/04/11 (金) 01:57:43 - しつもん
NEBのカタログによるとAvaIはCYCGRGという配列を認識する制限酵素のようです。
CYCGRGというのは、CTCGAG/CCCGGGだけで、CTCGGG/CCCGAGは含まないのですか?
解析ソフトによっては、CTCGGGやCCCGAGも認識するのですが、どっちが正しいのでしょうか?
詳しい方がいたら教えて下さい。

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