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糖鎖データベース探しています。 トピック削除
No.922-TOPIC - 2008/04/06 (日) 14:41:10 - anonyman
はじめまして、

動物細胞の実験系を組む上で、糖鎖の発現パターンを
調べる必要があるのですが、あまり良いデータベース
がありません。

どなたかご存知ありませんでしょうか?
 
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(無題) 削除/引用
No.922-4 - 2008/04/08 (火) 07:00:02 - ぐりこ
すいません、初めの質問の内容を取り違っていました。
予備実験として糖鎖の発現パターンを解析されるのかと思っていました。

特定の細胞での糖鎖の発現パターンのデータベースないと思います。また、そのような論文すらないかもしれません。
理由は、ご指摘のように糖鎖の分野のデータベース化が遅れていることもありますが、なによりも、データベース化するのには糖鎖の種類が膨大すぎます。
ある特定の糖鎖が、どの細胞で発現しているのかという情報は見つかると思います。しかし、ある細胞で発現している糖鎖の種類を網羅的に調べることは、技術的にまだ不可能ですので、そのような情報はないと思います。

ぐりこさん、有難うございます。 削除/引用
No.922-3 - 2008/04/07 (月) 16:47:48 - anonyman
ぐりこさん、ご指摘有難うございます。

具体的には、
動物由来CHO細胞及び昆虫由来のSF9細胞
での糖鎖発現パターンを調べていました。

まだ紹介頂いたDBを全て見れてはいないですが
いまの所、見つかっていません。

やはり、未だ糖鎖のDB化に関してはこれからと
いう感じなのでしょうか。

もし、上記発現パターンに心当たりがおありでし
たらご教授いただければ非常に嬉しいです。

それではもう少し調べてみます。
取り急ぎ、お礼とご報告を兼ねまして、、

(無題) 削除/引用
No.922-2 - 2008/04/07 (月) 11:27:59 - ぐりこ
糖鎖と言っても、あまりに種類がありすぎて、全てを網羅したデータベースはないかと思います。
具体的な糖鎖の種類と知りたい内容(発現、構造、機能、生合成遺伝子など)を上げたほうが回答しやすいかもしれません。

いろいろと調べられたのであれば、多分行き着いているとは思いますが、一応Glyco forumのリンクのアドレスを張っておきます。
ここにあるデータベースのリンク以外にも、各研究室のHPからいくつのデータベースへいけると思います。

http://glycoforum.gr.jp/link/linkE.html

糖鎖データベース探しています。 削除/引用
No.922-1 - 2008/04/06 (日) 14:41:10 - anonyman
はじめまして、

動物細胞の実験系を組む上で、糖鎖の発現パターンを
調べる必要があるのですが、あまり良いデータベース
がありません。

どなたかご存知ありませんでしょうか?

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