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EMSAについて トピック削除
No.911-TOPIC - 2008/04/03 (木) 14:18:37 - huku
NFkBのEMSAをはじめようと思っております。
我々の研究室では、「NFkB consensus oligonucleotides」というのをラベリングして行っていました。ですが、最近の論文では、遺伝子特異的なプロモーターの配列をラベリングしてやっているようなのですが、もはや前者の方法は古いのでしょうか?
 
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No.911-4 - 2008/04/04 (金) 14:06:26 - huku
わかりました!
ご丁寧な解説ありがとうございました

(無題) 削除/引用
No.911-2 - 2008/04/03 (木) 15:03:12 - おお
まずは、実験の目的によるところがあると思います。NfkBの活性化がみたいのか、NfkBにより、ある特定の遺伝子の転写の活性化などが起こることをみたいのかです。
後者では、たとえNfkBの活性化や結合活性がよく使われているコンセンサス配列で見られても、注目している遺伝子の転写の活性化の根拠にするには弱いと思いませんか?また、NFkBの活性が動くかどうかは、樹立された配列で見るのがいいと思いませんか?
ただし、お使いのコンセンサスも多分、何かの遺伝子のプロモーター(エンハンサー)由来だと思いますよ。一度調べられるといいかと思います。

EMSAについて 削除/引用
No.911-1 - 2008/04/03 (木) 14:18:37 - huku
NFkBのEMSAをはじめようと思っております。
我々の研究室では、「NFkB consensus oligonucleotides」というのをラベリングして行っていました。ですが、最近の論文では、遺伝子特異的なプロモーターの配列をラベリングしてやっているようなのですが、もはや前者の方法は古いのでしょうか?

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