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(無題) 削除/引用 No.834-6 - 2008/03/17 (月) 23:39:02 - たけ 皆様ありがとうございます． ちなみに，皆様は転写因子（ステロイド受容体結合部位）結合部位を検索するサイトで何かおすすめのサイトはありますでしょうか？

(無題) 削除/引用 No.834-5 - 2008/03/17 (月) 13:00:23 - おお >おっしゃるように、まずはレポーターassayで転写が動く調べるのが常套策だと思います。その上で結合配列と思われる部位をchipするという方法ですよね chipにこだわらなくても良いのではないでしょうか。もちろん直接的だとは思いますが。 結合している可能せいを示すのにゲルシフトやフットプリントなどいろいろな方法があります。ふっとプリント少し技術は入りますが、、、Chipはうまくいまない事も多々ありますし幅広く構えた方がいいかと思います。

(無題) 削除/引用 No.834-4 - 2008/03/17 (月) 12:23:06 - RXR ＞転写因子サイトで結合配列部位と列挙されても、そこには転写因子が結合しないということもよく＞あるのでしょうか？ はい、多々あります。

(無題) 削除/引用 No.834-3 - 2008/03/17 (月) 12:00:12 - たけ RXRさん＞ ありがとうございます。 転写因子検索サイトである遺伝子のプロモーターを調べたところ、ステロイド受容体結合配列である可能性の部位が何箇所かあがりました。今まで論文で報告されていないので、結合しないのかもしれませんが・・・ おっしゃるように、まずはレポーターassayで転写が動く調べるのが常套策だと思います。その上で結合配列と思われる部位をchipするという方法ですよね 転写因子サイトで結合配列部位と列挙されても、そこには転写因子が結合しないということもよくあるのでしょうか？

(無題) 削除/引用 No.834-2 - 2008/03/17 (月) 11:25:08 - RXR たけさんのラボでChipのシステムが動いているようでしたらそれでいいと思いますが（条件設定が結構たいへんかと）、まずはレポーターアッセイで確認する方が安易だと思います。

ステロイド受容体の結合配列 削除/引用 No.834-1 - 2008/03/17 (月) 09:35:14 - たけ ある遺伝子のpromoterにステロイド受容体の結合配列があるかどうかを調べたいと思います。 こういった場合には、どういた手順をとるのがよいのでしょうか？ 転写因子検索サイトであたりをつけて、そこをCHIPで落とすというやりかたでもよいでしょうか？ また、ステロイド受容体の結合配列があるかどうかを検索するのに良いサイトがありましたら教えていただけませんでしょうか？？ よろしくお願いいたします。

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