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タンパクのmultimerization
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No.741-TOPIC - 2008/02/26 (火) 09:51:51 - とも
現在タンパクの多量体形成をみたいのですが、なかなかうまくいきません。
native PAGEを使ったり、cross-linkさせたりしましたが、ウエスタンでみるとラダーになってしまい、dimerやtetramerのバンドが全くみえません。
このような実験やったことある人いましたら、何か良い方法教えてください。
ちなみにcross-linkerでDTSSP使ったことある人いましたら、どのように反応させたか教えてください。
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No.741-7 - 2008/02/28 (木) 00:18:52 - コントロール
>反応時間は30〜60分で振って濃度も振ったんですけど、うまくいきませんでした。
つまり、荒く振るというのは1分とかも含める、濃度も100(10)分の一とかということになります。もちろん、架橋材マイナスコントロールではモノマーの位置にあるべきです。
(無題)
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No.741-6 - 2008/02/27 (水) 18:07:50 - とも
Tさんコメントありがとうございます。
invitrogenのBlue Native PAGEもやりました。
いろいろ条件変えたんですがうまくいきませんでした。
(無題)
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No.741-5 - 2008/02/27 (水) 12:40:24 - T
Blue Native PAGE は?
(無題)
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No.741-4 - 2008/02/27 (水) 11:27:27 - とも
標準さん、Aさんコメントありがとうございます。
反応時間は30〜60分で振って濃度も振ったんですけど、うまくいきませんでした。
ゲルろ過は何度かやってdimer、tetramerがみえたので、gel上でもみたいなと思って実験しています。
あとtagをかえてIPなどでも同じタンパク同士の結合が見えたので、dimer以上はとっていると思うんですけど、gelではうまくいきませんでした。
論文などと同じ方法でやっても無理だったので、他の方法を検索してみます。
(無題)
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No.741-3 - 2008/02/26 (火) 18:28:04 - A
ゲルろ過は多量体確認に良く使われます。
ただゲルろ過カラムは非特異的に蛋白質が結合する可能性が
ありますから塩濃度を0.5-1Mにしたり界面活性剤を入れたりします。
もしそれらの添加が出来て十分量のサンプルがあるのであれば
ゲルろ過を試す価値はあると思います。
(無題)
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No.741-2 - 2008/02/26 (火) 12:46:23 - 標準
cross-linkの場合は、反応時間、架橋剤濃度を荒めに振ってみるとよいでしょう。dimerのバンドが見えないから失敗と言うことにはならないと思います。
タンパクのmultimerization
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No.741-1 - 2008/02/26 (火) 09:51:51 - とも
現在タンパクの多量体形成をみたいのですが、なかなかうまくいきません。
native PAGEを使ったり、cross-linkさせたりしましたが、ウエスタンでみるとラダーになってしまい、dimerやtetramerのバンドが全くみえません。
このような実験やったことある人いましたら、何か良い方法教えてください。
ちなみにcross-linkerでDTSSP使ったことある人いましたら、どのように反応させたか教えてください。
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