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ISOGEN法によるmRNA抽出 トピック削除
No.719-TOPIC - 2008/02/21 (木) 23:26:07 - tao
いつも参考にさせていただいています。

今回マウスの骨髄由来培養マスト細胞(BMMC)からmRNAを抽出しようとしているのですが、ニッポンジーンのISOGENを用いているのですが、あまり抽出率がよくありません。
また、cDNA合成を行って、GAPDHをプライマーに用いてPCRを行っているのですが、なぜかバンドの検出がうまくいきません。

どなたかなにかアドバイスをいただけないでしょうか?
 
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(無題) 削除/引用
No.719-4 - 2008/02/22 (金) 20:08:14 - tao
ありがとうございます!
早速試してみます!

(無題) 削除/引用
No.719-3 - 2008/02/22 (金) 14:04:11 - てんてこ
 RNAが分解されていないか、電気泳動でチェックしてみては?

 私の経験ですが、TRIzolでは抽出が成功してISOGENではRNAが分解(電気泳動でバンドが見えない)していた、マウスのサンプルでは成功したがヒトでは分解していた(TRIzolなら成功)、という不可解な事がありました。
 ISOGENでホモジナイスした後、一度遠心して上清を取り、これにクロロホルムを加えると上手くRNAが取れました(詳細はISOGENのマニュアルに載っています)。
 頑張ってください。

(無題) 削除/引用
No.719-2 - 2008/02/22 (金) 02:30:53 - ぽすど君
質問があまりに漠然とし過ぎなので,あまり回答得られないと思いますよ.

BMMC以外はうまくいっているのか?
RNA抽出の具体的な手順は?
cDNA合成の具体的な手順は?

などなど.

ISOGEN法によるmRNA抽出 削除/引用
No.719-1 - 2008/02/21 (木) 23:26:07 - tao
いつも参考にさせていただいています。

今回マウスの骨髄由来培養マスト細胞(BMMC)からmRNAを抽出しようとしているのですが、ニッポンジーンのISOGENを用いているのですが、あまり抽出率がよくありません。
また、cDNA合成を行って、GAPDHをプライマーに用いてPCRを行っているのですが、なぜかバンドの検出がうまくいきません。

どなたかなにかアドバイスをいただけないでしょうか?

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