実験を初めてまだ数ヶ月、本当に素人でお恥ずかしいのですが
質問させてください。
助教授の先生からとある塩基配列を特定して欲しいと頼まれました。
7割型配列が分かってはいるものの、BLAST検索で分からない部分がちょこちょこあったため
だと聞きました。
3カ所の配列を読みたいため、プライマーは業者に頼み、6本あります。
そこで実際sequencerにかける前に、PCRをしますよね!?
テンプレートDNA、プライマー、シークエンスバッファー、BIG-DYE,MiliQ水
を加え、それぞれフォワードとリバースで。
そこで質問なんですが...
フォワード、リバースにはプライマーってどういう組み合わせで入れるのですか??
またはフォワードには1つのプライマー、リバースには1つのプライマーしかいれないのですか??
読みたい場所を仮に A B Cとします。
Aのプライマーを仮に a a'
Bのプライマーを仮に b b'
Cのプライマーを仮に c c'
とすると
Aのフォワードにはaを、リバースにはa'を入れれば良いのですか!?
教えてください!! |
|