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アミノ酸配列と酵素名から切断部位を予測するツール トピック削除
No.599-TOPIC - 2008/01/30 (水) 06:09:30 - K
アミノ酸配列と酵素名からどの部分を切断するかを予測するツールについてご存知の方お教えいただけないでしょうか。MSフラグメントからアミノ酸配列を検索するシステム(mascotなど)の逆方向に検索するイメージです。

パパインのように基質特異性がわかっているのであれば、目で探せばよいことなのですが、それ自体は単純な作業に思えるのでどちらかでツールとして公開されていないものかと思った次第です。

拙い質問で恐縮です。宜しくお願いいたします。
 
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Expasyいいですね 削除/引用
No.599-3 - 2008/02/02 (土) 07:38:27 - K
MSMS様

さっそくのぞいてきました。探していたツールはこのようなものです。
やっぱりあるんですね。Expasyも今後活用していきます。

紹介ありがとうございました。

expasy 削除/引用
No.599-2 - 2008/01/31 (木) 06:43:55 - MSMS
http://www.expasy.ch/tools/peptidecutter/
これはいかが?
expasy内の他のサイトも役に立ちますよ。

アミノ酸配列と酵素名から切断部位を予測するツール 削除/引用
No.599-1 - 2008/01/30 (水) 06:09:30 - K
アミノ酸配列と酵素名からどの部分を切断するかを予測するツールについてご存知の方お教えいただけないでしょうか。MSフラグメントからアミノ酸配列を検索するシステム(mascotなど)の逆方向に検索するイメージです。

パパインのように基質特異性がわかっているのであれば、目で探せばよいことなのですが、それ自体は単純な作業に思えるのでどちらかでツールとして公開されていないものかと思った次第です。

拙い質問で恐縮です。宜しくお願いいたします。

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