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TAPタグ
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No.338-TOPIC - 2007/10/16 (火) 11:23:29 -
するたん
初めて書きこみします。
現在カナダ留学中で、TAPタグをつけたタンパクの精製を行っています。
TAPタグはprotein G-TEV-stretavidin binging protein というコンストラクトを使っているのですが、どうしてもTEVがきれなくて、western blot で確認すると、IgG beads に残ってしまっているようです。
TAPタグ精製の経験がある、あるいは知識がある方にお伺いしたいのですが、
1.TEVを切るときのバッファーなどの条件はどうしているか
私は目的タンパクの活性を保存したまま抽出したいので、一般的なTAPのプロトコールで使われるバッファーは使っていません(といってもそんなに特殊なバッファーではありませんが)。
2.ひょっとして、バッファーに加えている protease inhibitor cocktail が悪さをしているのでは、と思ったりしているのですが、そんなことは実際にありえるでしょうか。
何かコツのようなものがあれば何でも教えてください。
よろしくお願いします。
するたん
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(無題)
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No.338-3 - 2007/10/16 (火) 15:14:27 - T
TEV protease FAQ
http://mcl1.ncifcrf.gov/waugh_tech/faq/tev.pdf
What protease inhibitors are known not to affect TEV?
PMSF and AEBSF (1mM), TLCK (1mM), Bestatin (1mg/ml), pepstatin A (1mM),
EDTA (1mM), and E-64(3mg/ml), “complete” protease inhibitor cocktail (Roche). Zinc
will inhibit the activity of the enzyme at concentrations of 5 mM or greater. Reagents
that react with cysteine (e.g., iodoacetamide) are potent inhibitors of TEV protease.
(無題)
削除/引用
No.338-2 - 2007/10/16 (火) 14:21:48 -
ats
TAPタグ精製の経験はありませんが、GST-tagを切り離した経験はあります。
protease inhibitor cocktailは広範囲のproteaseを阻害するように混合されていますので「悪さ」をしている可能性は高いです。
目的タンパクをビーズに結合したあと、 inhibitor cocktailを加えていないbufferで洗浄してから、切り出しを行うことをお奨めします。
もしくは、TEVを阻害しないinhibitor(何かは知りません。)のみ加えるとか。
TAPタグ
削除/引用
No.338-1 - 2007/10/16 (火) 11:23:29 -
するたん
初めて書きこみします。
現在カナダ留学中で、TAPタグをつけたタンパクの精製を行っています。
TAPタグはprotein G-TEV-stretavidin binging protein というコンストラクトを使っているのですが、どうしてもTEVがきれなくて、western blot で確認すると、IgG beads に残ってしまっているようです。
TAPタグ精製の経験がある、あるいは知識がある方にお伺いしたいのですが、
1.TEVを切るときのバッファーなどの条件はどうしているか
私は目的タンパクの活性を保存したまま抽出したいので、一般的なTAPのプロトコールで使われるバッファーは使っていません(といってもそんなに特殊なバッファーではありませんが)。
2.ひょっとして、バッファーに加えている protease inhibitor cocktail が悪さをしているのでは、と思ったりしているのですが、そんなことは実際にありえるでしょうか。
何かコツのようなものがあれば何でも教えてください。
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