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(無題) 削除/引用 No.318-3 - 2007/10/13 (土) 18:54:48 - プラント 私は下記の２個のデーターベースを利用しております。 Locus serachまたはBLAST serchで目的の遺伝子のタグラインを検索できます。 RiceGE: Rice Functional Genomic Express Database http://signal.salk.edu/cgi-bin/RiceGE OryGenesDB http://orygenesdb.cirad.fr/tools.html ご参考までに。

(無題) 削除/引用 No.318-2 - 2007/10/11 (木) 12:19:55 - う〜んと Tos17挿入変異体系統は農業生物資源研究所で開発したものですので、そちらに当たられるのが確実だと思います。 http://www.rgrc.dna.affrc.go.jp/jp/stock.html Tos17の新規に挿入された場所の周辺配列をデータベース化してBLAST検索できるようにしているので、関心のある遺伝子の配列を投げてヒットすれば、その変異系統の整理番号が表示されると思います。 投げる配列はゲノム配列のほうがいいでしょう。

イネのTag lineの検索法 削除/引用 No.318-1 - 2007/10/11 (木) 00:31:14 - けん坊 イネには、T-DNA、Tos17などのタグラインがあるようなのですが、自分の扱っている遺伝子のタグラインがあるかどうか調べ方がわかりません。 Tos17ミュータントの検索では、クエリ配列をBLASTのような手順でコピペして検索まではできるのですが、そのあとの見方が良くわかっていません。 ご存知の方がいたら教えてください。 また、イネのミュータントデータベースについても教えてください。

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