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(無題) 削除/引用 No.2712-9 - 2009/02/02 (月) 13:49:17 - 膜マリー ありがとうございます。 レスが遅くなってしまい、申し訳ありません。 まだまだ、勉強不足で恥ずかしい限りですが、 登録と公開が分けられているのですね。 共同研究者が絡んできてややこしい感じのようなので、 今回は手書きにしました。 色々とご教授頂き、本当にありがとうございました。 「解決」にチェックができないのですが、 この問題はAさんとPさんのおかげで解決いたしました。 ありがとうございました。

(無題) 削除/引用 No.2712-8 - 2009/01/29 (木) 00:29:55 - P > 登録から図の作製まで結構早いのですね。 > > 私は一学生ですので、教授と相談して登録してみようと思います。 登録(deposit)と公開(release)は別ですよ． 普通は，論文投稿時にdepositして，publishされたら公開です．

(無題) 削除/引用 No.2712-7 - 2009/01/28 (水) 10:31:15 - 膜マリー >Pさん ご返信、ありがとうございます。 登録から図の作製まで結構早いのですね。 私は一学生ですので、教授と相談して登録してみようと思います。 どうもありがとうございました。

(無題) 削除/引用 No.2712-6 - 2009/01/28 (水) 05:05:17 - P > …登録すれば書いてくれるのでしょうか？ たぶん機械的にやっていると思うので，座標が公開されれば 描いてくれるのではないでしょうか． 先週にreleaseされた座標もすでに描かれています．

(無題) 削除/引用 No.2712-5 - 2009/01/27 (火) 11:02:26 - 膜マリー ＞Pさん ご返信ありがとうございます。 EMBLにて、相同タンパクのトポロジー図を見つけることができました。 ただ今回はPDBに登録されていないので、やはり手書きしかないようです。 …登録すれば書いてくれるのでしょうか？

(無題) 削除/引用 No.2712-4 - 2009/01/27 (火) 08:06:46 - P 綺麗かどうかは？？ですが， すでにPDBに登録されている座標なら， EMBL-EBIのPDBsumからPromotifで描かれた ファイルをダウンロードできます．

(無題) 削除/引用 No.2712-3 - 2009/01/27 (火) 03:02:14 - 膜マリー ご返信、ありがとうございます。 手書きですか。 確かに、プログラムを使って綺麗に書けないのでは、 手書きの方が良いかもしれませんね。 相同タンパクの論文にトポロジー図が載っている論文は持っていますので、 今回は手書きで頑張ります。 ありがとうございました。 もし、綺麗に書けるプログラムをご存知の方がおりましたが、 後学のためにも知っておきたいので、お教えください。 よろしくお願いいたします。

(無題) 削除/引用 No.2712-2 - 2009/01/26 (月) 16:49:12 - A 以前何がしかのプログラムを使って作ったことがありますが今ひとつ わかりにくい図しかできなかったためそれはあきらめて、相同な タンパク質のトポロジー図の載っている論文から図を貰ってきてそれを 元図として手書きしました。さすがに半日ほどかかりましたがプログラム 使ったものよりはわかりやすい図になりました。過去の論文で相同な トポロジー図の載っているものを探してみては？

タンパク質構造のトポロジー図作成について 削除/引用 No.2712-1 - 2009/01/23 (金) 12:26:28 - 膜マリー PDBファイルからトポロジー図を作成する方法を探しています。 TOPSやTOPDrawといったサイトを当たってみたのですが、 現在は動いていないらしく、困っています。 どうぞよろしくお願いいたします。

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