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ヒストンがエッペンにくっついてしまいます! トピック削除
No.2707-TOPIC - 2009/01/22 (木) 22:38:08 - あきひろ
ヒストン修飾に関する実験を行っています。

ヒストンを修飾酵素と反応させているのですが、ヒストンがエッペンに吸着してしまい困っています。

ヒストンの濃度は70ng/ulで3% NP40が入っていますが、ほぼ全てがエッペンに吸着しているようです。


何か対処法をご存知の方がおられたらよろしくお願いいたします。
 
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(無題) 削除/引用
No.2707-7 - 2009/02/04 (水) 17:40:17 - あきひろ
返事が遅くなりました。

今回は、ヒストンの濃度を300ng/ulにまで上げ、さらにeppendorf社のprotein lobind tubeを用いてみましたところ、壁への吸着は無視できるようになりました。

とりあえずこの条件で進めていこうと思います。

アドバイスありがとうございました。

親水性の低吸着チューブ 削除/引用
No.2707-6 - 2009/01/26 (月) 00:21:24 - K
シリコン化のように壁面を疎水性にコーティングした場合、
壁面の面積の分だけ蛋白質が吸着していきます。
(疎水性にして水切れをよくしているだけ)
そのような場合、親水性コーティングのほうが低吸着性になるようです。
会社の回し者ではありませんが、プロテオセーブとか。
この商品を使ったことがありますが、それでも吸着します。(水切れが悪くなるのも一因)
完璧に吸着をブロックするものはない、と理解していますが、
APさん、名無しさんが書かれている方法は効果ありでした。

改善できたら、ぜひ結果を教えてください。

(無題) 削除/引用
No.2707-5 - 2009/01/23 (金) 01:51:38 - 名無し
ヒストンのプラスチャージが悪さしてるなら塩たせばばどう?それかCHAPSみたいな両イオン性界面活性剤とか。チャージの問題だとNP-40はいくらいれても効かないでしょう。

(無題) 削除/引用
No.2707-4 - 2009/01/22 (木) 23:49:32 - ザンギ
塩基性たんぱくは、シリコナイズすると吸着が増えるんじゃなかったかなぁ。
エッペンドルフ社等から低吸着タイプのチューブが出てたと思います。

(無題) 削除/引用
No.2707-3 - 2009/01/22 (木) 23:28:21 - AP
ヒストンを扱ったことはないですが、
どんなタンパク質試料(あるいは核酸)であっても吸着性はあります。ヒストンは非常に強い正電荷を持っているので、吸着しやすそうですね。

シリコナイズは一つの方法ですが、昔から(ガラスピペットが主流だったかろから)行われている方法はあらかじめ、適当なタンパク質溶液(唾液を使うというのもあったようです)を通してブロッキングすることです。

反応系に干渉しないタンパク質である必要がありますが、この場合、例えばBASやヘパリン溶液などが使えるかもしれません。あるいは、ヒストンの試料がたくさんあるなら、一部をブロッキング用に使うとか。

(無題) 削除/引用
No.2707-2 - 2009/01/22 (木) 23:11:40 - A
シリコナイズ済みのチューブが販売されていますから
出入りの業者さんからサンプルを貰って試してみては?

ヒストンがエッペンにくっついてしまいます! 削除/引用
No.2707-1 - 2009/01/22 (木) 22:38:08 - あきひろ
ヒストン修飾に関する実験を行っています。

ヒストンを修飾酵素と反応させているのですが、ヒストンがエッペンに吸着してしまい困っています。

ヒストンの濃度は70ng/ulで3% NP40が入っていますが、ほぼ全てがエッペンに吸着しているようです。


何か対処法をご存知の方がおられたらよろしくお願いいたします。

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