Bio Technical フォーラム

  • 書き込みがかなり増えてしまいサーバーの負荷が大きくなったので、新しいBioTechnicalフォーラムに移行してください。
  • 新しいトピックは新フォーラムでのみ立ち上げ可能です。レスは2009年2月15日までつけられますが、その後は、つけられません。

トピック一覧 | 研究留学ネットに戻る

最新のフォーラム | このフォーラム(readのみ) | ひとつ前のフォーラム(readのみ)

このスレッドをはてなブックマークに追加このスレッドをはてなブックマークに追加

キナーゼの同定もしくは絞り込み トピック削除
No.2595-TOPIC - 2009/01/04 (日) 12:40:38 - 赤
皆さんのお知恵を拝借したく、トピックを立てさせていただきます。

培養細胞にあるタンパク質を強制発現させ、IPにより粗精製し、SDS-PAGE/Westernで解析を行うと、シフトバンドが検出されます。またこのシフトバンドはCIP処理にて消失します。今後、リン酸化部位はMASSで同定しようと思っております。

さてこの際、どのような方法によりこのタンパク質をリン酸化するキナーゼを同定することができますでしょうか。

今後同定されうるリン酸化部位から、候補をピックアップし、インヒビターを試すなどを考えておりますが、それ以外に何か方法があれば、教えていただけないでしょうか。
 
- このトピックにメッセージを投稿する -



6件 ( 1 〜 6 )  前 | 次  1/ 1. /1


(無題) 削除/引用
No.2595-6 - 2009/01/09 (金) 13:19:28 - 赤
中年さん

不勉強でした。調べてみました。
検討してみます。
ありがとうございました。

(無題) 削除/引用
No.2595-5 - 2009/01/05 (月) 10:49:49 - 中年
まずはGoogleで「kinome RNAi」と検索されてみてはどうですか?それでも手がかりが得られなかったということであれば、こちらでも資料を捜してみますのでその旨仰ってください。

(無題) 削除/引用
No.2595-4 - 2009/01/05 (月) 02:09:51 - 赤
>>人事労務さん
ありがとうございます。それが一番無難なんですかね。

>>中年さん
ありがとうございます。中年さんがおっしゃているのはヒトゲノムなのでしょうかそれともkinaseをカバーするセットなのでしょうか。自分で調べればよいのでしょうが、申し訳ありません。教えていただけないでしょうか。

(無題) 削除/引用
No.2595-3 - 2009/01/04 (日) 23:13:58 - 中年
ヒトkinomeをカバーするsiRNAかshRNAのセットを売ってるので、バンドシフトが消失することを指標にスクリーニングを掛けるのは?

(無題) 削除/引用
No.2595-2 - 2009/01/04 (日) 21:45:32 - 人事労務
まあそうですね。
リン酸化部位からコンセンサス配列を元に探すのが無難ですね。

それかインヒビターですかね。

って赤さんが仰ってることまんまですねorz

でもそれが一番無難で早道じゃないでしょうか?

キナーゼの同定もしくは絞り込み 削除/引用
No.2595-1 - 2009/01/04 (日) 12:40:38 - 赤
皆さんのお知恵を拝借したく、トピックを立てさせていただきます。

培養細胞にあるタンパク質を強制発現させ、IPにより粗精製し、SDS-PAGE/Westernで解析を行うと、シフトバンドが検出されます。またこのシフトバンドはCIP処理にて消失します。今後、リン酸化部位はMASSで同定しようと思っております。

さてこの際、どのような方法によりこのタンパク質をリン酸化するキナーゼを同定することができますでしょうか。

今後同定されうるリン酸化部位から、候補をピックアップし、インヒビターを試すなどを考えておりますが、それ以外に何か方法があれば、教えていただけないでしょうか。

6件 ( 1 〜 6 )  前 | 次  1/ 1. /1


パスワードを入力してチェックした記事を チェックした記事を