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ゲノム図の見方
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No.2577-TOPIC - 2008/12/27 (土) 20:48:22 - とと
NCBIの検索でGeneを選択し目的の遺伝子の情報を検索し見ていました。
上段の方にGenomic contextというのがありました。
そこにはゲノム上のどの位置に遺伝子があるかを書いてありますが、
矢印の向きが逆向きのものがあります。
遺伝子の読みとられ方は、5末端から3末端にのみだと思いますが、
矢印の右向きと左向きはどういう意味なのでしょうか。
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(無題)
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No.2577-9 - 2008/12/29 (月) 10:34:54 - とと
みなさま、ありがとうございます。
今までの勘違いがはっきりと解りすっきりしました。
(無題)
削除/引用
No.2577-8 - 2008/12/29 (月) 04:39:27 -
おお
>[Re:7] ととさんは書きました :
> ということは、転写の向きが異なるものの遺伝子同士がオーバーラップしているところもあるということでしょうか。
確かあったと思います。同一の向きでも
オーバーラップしているものもあります。
(無題)
削除/引用
No.2577-7 - 2008/12/28 (日) 23:06:46 - とと
なるほど。
すっきりしました。
ありがとうございます。
今まで、すべての遺伝子は同一の鎖の上にコードされていると思っていました。とんだ勘違いですね。
ということは、転写の向きが異なるものの遺伝子同士がオーバーラップしているところもあるということでしょうか。
(無題)
削除/引用
No.2577-6 - 2008/12/28 (日) 22:11:01 - 中年
「センス鎖にのみ遺伝子がコードされている」のはそのとおりです。それが定義ですから。でも、2重鎖のどちらがセンス鎖かは遺伝子ごとに違っていて構いません。
(無題)
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No.2577-5 - 2008/12/28 (日) 20:26:57 - とと
間違えました。
逆ですね。
読まれるのはDNAのアンチセンス鎖で、遺伝子をコードしているのが
センス鎖ですね。
要するに、センス鎖にのみ遺伝子がコードされていると思っていました。
疑問点としては、アンチセンス鎖も遺伝子をコードしていて、センス鎖を鋳型に転写が進むことがあるということでしょうか。
一方の鎖しか転写されないというのは私の理解の不足、解釈違いということでしょうか。
(無題)
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No.2577-4 - 2008/12/28 (日) 20:11:24 - とと
ありがとうございます。
教科書では遺伝子の転写はセンサ側のみ読み取られると習った気がしたのですが
逆鎖も遺伝子がコードされているということでしょうか。
(無題)
削除/引用
No.2577-3 - 2008/12/28 (日) 04:34:45 -
おお
>[Re:2] pさんは書きました :
> DNAって
>
> 5'−−−−−−−−−3'
> 3'−−−−−−−−−5'
>
このpさんの図の下のストランドの側に<-の矢印を入れたものを
上に書いて、180度回転させてみてください。
180度回転まえの<-で示される遺伝子はどこにコード
されてるか検討がつくと思います。
(無題)
削除/引用
No.2577-2 - 2008/12/27 (土) 21:14:37 - p
DNAって
5'−−−−−−−−−3'
3'−−−−−−−−−5'
ってなっているので、
→方向にコードされているだけでなく
←方向にコードされている可能性もありますね?
超適当ですいません。
ゲノム図の見方
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No.2577-1 - 2008/12/27 (土) 20:48:22 - とと
NCBIの検索でGeneを選択し目的の遺伝子の情報を検索し見ていました。
上段の方にGenomic contextというのがありました。
そこにはゲノム上のどの位置に遺伝子があるかを書いてありますが、
矢印の向きが逆向きのものがあります。
遺伝子の読みとられ方は、5末端から3末端にのみだと思いますが、
矢印の右向きと左向きはどういう意味なのでしょうか。
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