high salt bufferで普通にnuclear extractionをすればいいことじゃないんですか?ただ、形態上の核が残っていることと、そこからの蛋白が抽出できているかは別問題と思います。核膜が物理的に潰れればDNAが出てきますからドロドロになります。それにいくつかの各特異的な蛋白の抗体でwesternをすればどの程度、核蛋白が取れているかわかると思います。
IPをするのであれば、そのcomplexがどの程度安定かはケースバイケースですから、抽出を優先する条件であれば複合体が維持できない可能性がありますので、とりあえず1% Triton, RIPA、Nuclear extraction、+/- sonicationなどいろんな一般的な条件を試してみたらいかがですか。 |
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