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(無題) 削除/引用 No.2541-3 - 2008/12/24 (水) 12:22:01 - うゆう 返信、ありがとうございます！ 添付していただいた論文、読ませていただきました。 理論的には、pocketの底まで届かない時には、 かなり力が弱まっていそうですね。 おっしゃっていただいた通り、ここから先はやってみないと分からない って感じな気がします。

(無題) 削除/引用 No.2541-2 - 2008/12/23 (火) 00:31:53 - A http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/8506353?dopt=Abstract この論文に結合に関する構造学的な考察がされていますから（結合に関与している水素結合やファンデルワールス力など）なにか参考になるかもしれません。 >5000bp程度のプラスミドにビオチンを持つ化合物を結合させた状態で >（化合物の長さは30Åくらい）アビジンを結合させようとすると、 >結合は起こるのか、起こるのなら結合力はどれくらい小さくなるのか >知りたいのです。 こればっかりはやってみないとわからないのでは。

ビオチンアビジン結合原理について 削除/引用 No.2541-1 - 2008/12/22 (月) 11:55:48 - うゆう ビオチンとアビジンの結合の原理について何か参考になる 論文などがありましたら教えてください。 何について知りたいのか書かせていただきますと ビオチンとアビジンの反応に関して、 ビオチンがアビジンに結合するためのbinding pocketの底までの距離が 60Åだということは分かったのですが、 ビオチンが結合している物質が非常にかさ高くて pocketの底まで届かない時にどの程度、結合力が弱まるのか 知りたいのです。 もう少し、具体的に書かせていただきますと、 5000bp程度のプラスミドにビオチンを持つ化合物を結合させた状態で （化合物の長さは30Åくらい）アビジンを結合させようとすると、 結合は起こるのか、起こるのなら結合力はどれくらい小さくなるのか 知りたいのです。 自分でもweb of scienceなどを使って探しているのですが それに完全に合致する論文を見つけられていないので、 ここに書かせていただきました。 よろしくお願いします。

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