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DNA exonucleaseについて
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No.2506-TOPIC - 2008/12/15 (月) 20:57:40 - アジール
DNA exonucleaseで一本鎖、二本鎖を問わずDNAを分解するものってありますか?ご存知でしたら教えて頂けると助かります。
ちなみに、分解の方向は問いません。
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有り難うございます
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No.2506-5 - 2008/12/16 (火) 18:27:03 - アジール
みなさん有り難うございました。助かりました。
はやり、2種類を混ぜて使うのが良いみたいですね。プラスミドの精製などでもexonucelase IとIIIを併用しているのをよく見かけますしね。
(無題)
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No.2506-4 - 2008/12/16 (火) 17:06:36 - AP
DNaseプロパーでは条件にぴったりのものは思い浮かびませんが、dNTPが非存在下でのT4 DNA polmeraseやDNA polymerase Iのexonuclease活性が該当するでしょう。
BAL21 nucleaseは、二重鎖特異的3' exo活性と、一本鎖特異的exdo活性があります。
exonuclease Iとexonuclease IIIのmixtureなら一本鎖も二重鎖も3'->5'で分解できると思います。
(無題)
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No.2506-3 - 2008/12/16 (火) 13:36:36 - p
dNTPいれずに、T4 polymerase とかどうなんでしょう?
どの組み合わせがいいのか分かりませんが
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No.2506-2 - 2008/12/16 (火) 09:48:36 - ~
dsDNA用とssDNA用を混ぜるのは駄目ですか?
Exonuclease TとT3 Exonucleaseだったら、
少なくとも同じバッファーと温度で活性があるみたいですけど。
http://www.neb.com/nebecomm/tech_reference/modifying_enzymes/prop_exonucleases_endonucleases.asp
DNA exonucleaseについて
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No.2506-1 - 2008/12/15 (月) 20:57:40 - アジール
DNA exonucleaseで一本鎖、二本鎖を問わずDNAを分解するものってありますか?ご存知でしたら教えて頂けると助かります。
ちなみに、分解の方向は問いません。
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