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神経細胞のRT-PCR トピック削除
No.2494-TOPIC - 2008/12/12 (金) 23:58:28 - canonan
培養細胞の神経系マーカーのRT-PCRをやってる論文で、NeurofilamentやNestinはよく見ますが、GFAPやCNPaseのRT-PCRをほとんど見たことがありません。
何か理由があるのでしょうか?

これらのRT-PCRをやろうと思い、プライマー配列を過去の論文で調べたのですが、NFやNestin以外が見あたらないもので、ちょっと気になっています。
 
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(無題) 削除/引用
No.2494-8 - 2008/12/15 (月) 13:07:38 - おお
グリアがある、なん%ある、または
(ほとんど)ない
とかの判定がしにくいのではないかと
(具体的に論文など見ずにですが)
推察しています。

(無題) 削除/引用
No.2494-7 - 2008/12/15 (月) 10:21:07 - よっしー
神経幹細胞から100%神経細胞に分化することは不可能です.
グリアもでてきますし,神経幹細胞も残ります.
そのような状態で,RT-PCRをすると,いずれのマーカーも
検出されてしまうので,免疫染色をしているのではないでしょうか.
何%の細胞が分化したって事が重要なのではないでしょうか.

(無題) 削除/引用
No.2494-5 - 2008/12/13 (土) 12:05:33 - canonan
ご回答ありがとうございます。

> CNPaseて何ですか?
オリゴデンドロサイトのマーカーとして知られています。

例えば、神経幹細胞がニューロン、アストロサイト、オリゴデンドロサイトに分化することが知られています。
このケースで幹細胞から分化誘導した場合に、分化した細胞を証明する手立てとして、個々のマーカー遺伝子の発現をRT-PCRでみるのはありそうだと思ったのですが、そのような論文が見あたらないのです。だいたい、蛍光免疫染色で見ているのみです。

どなたか、GFAPとCNPaseのRT-PCRをやっている論文をご存じないでしょうか?

(無題) 削除/引用
No.2494-4 - 2008/12/13 (土) 11:52:58 - おお
ちょっと目的というか、何をやろうとしているのかとか
具体性にかけるのでアドバイスできませんが、NeurofilamentやNestin
ではあなたの実験系ではダメということなのでしょうか、
神経で発現していてたとしてもマーカーとして使われてないようであれば
マーカーとしては使えないということですよね、それでも
そういう遺伝子にこだわる必要があると思っているのでしょうか、、

(無題) 削除/引用
No.2494-3 - 2008/12/13 (土) 10:59:04 - ぽっぽー
そうですね、GFAPはアストロが出してますよね

(無題) 削除/引用
No.2494-2 - 2008/12/13 (土) 01:05:12 - りょう
GFAPはアストロサイトのマーカーですよね。
neuronを研究対象にしているならRT-PCRで検討しないのは当然です。
あなたの言う神経系とはneuronですか?アストロ?オリゴデンドロサイトですか?
質問文からは読み取れませんが。

CNPaseて何ですか?ググッってみたところ微小管蛋白結合蛋白ですかね。majorな遺伝子とは思えませんから、論文でなかなか見つからないのは容易に予想できます。これがneuronに発現しているのかは知りませんが、neuronの免疫染色で用いられる微小管結合蛋白はMAP2ですよね。MAP2なら樹状突起を持っているneuronならRT-PCRできると予想できます。

神経細胞のRT-PCR 削除/引用
No.2494-1 - 2008/12/12 (金) 23:58:28 - canonan
培養細胞の神経系マーカーのRT-PCRをやってる論文で、NeurofilamentやNestinはよく見ますが、GFAPやCNPaseのRT-PCRをほとんど見たことがありません。
何か理由があるのでしょうか?

これらのRT-PCRをやろうと思い、プライマー配列を過去の論文で調べたのですが、NFやNestin以外が見あたらないもので、ちょっと気になっています。

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