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(無題) 削除/引用 No.2456-3 - 2008/12/08 (月) 16:49:39 - おお >[Re:1] さやさんは書きました : > 対数増殖期真っ只中の菌と、減衰期手前の菌では > どちらの方が遺伝子の発現が多いでしょうか？ これって質問になってるような、なってないような、、、 amiさんがツンとコメントしてください! > また遺伝子発現量を比較する際には、どのタイミングでサンプリングを > 行なうことがベストでしょうか？ まず、あなたの破壊した遺伝子の性質から 何が期待できますか?それがどの細胞の増殖の フェイズで重要ですか? もしそれが分からないなら、あなたの破壊した 遺伝子は従来どの細胞の増殖のフェイズで発現 して(機能を発揮して)いるのかを実際に 各フェーズの発現量を調べてから、よく発現 しているフェーズで、比較した方がいいかもしれません 全く発現していないフェーズで比較しても意味がありませんから。 たいていの場合は対数増殖期(の後期)で細胞を とると思いますが、それがいつも正解とはいえません。

(無題) 削除/引用 No.2456-2 - 2008/12/08 (月) 15:59:36 - よっしー ものによって違います． 対数増殖前期しか発現しない物，中期以降にするもの，後期から発現するもの 様々です． ですから対数増殖前期，中期，後期，定常期で比較するのが良いと思います． ターゲットが決まっているのでしたら，そのターゲットが発現している時期だけでもいいのかもしれませんが・・・．

増殖期における遺伝子発現量 削除/引用 No.2456-1 - 2008/12/08 (月) 15:44:26 - さや 現在、親株と遺伝子組み換え株において、 遺伝子の発現量を比較する実験（リアルタイムRT-PCR）を行っています。 具体的には、前培養を２回行なった後、ジャーファメンターで培養を行い、 増殖曲線を作成しながらサンプリングを行なっています。 ここでアドバイスを頂きたいのが、サンプリングのタイミングです。 現在は、対数増殖期から減衰期に入る手前を目安として サンプリングを行なっています。 その理由は一番菌体量が多くて菌が活発な時だと考えたからです。 あまりに初歩的は質問で申しわけないのですが、 対数増殖期真っ只中の菌と、減衰期手前の菌では どちらの方が遺伝子の発現が多いでしょうか？ また遺伝子発現量を比較する際には、どのタイミングでサンプリングを 行なうことがベストでしょうか？

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