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細胞周期に関するある論文で。 トピック削除
No.2433-TOPIC - 2008/12/04 (木) 10:30:46 - 初心者
Soo-A Kim et al: 5'NIO induces G2/M cell cycle arrest

我々の実験室で細胞周期に詳しい人が居りませんので、場違いかもしれませんが教えて下さい。
上記論文では癌細胞にG2/M arrestを起こす薬剤に関して書かれています。
その中で、

G0/G1 52.7%(control)→40.1%(薬剤1μM)→21.4%(薬剤2.5μM)
S 11.4%(control)→7.3%(薬剤1μM)→9.2%(薬剤2.5μM)
G2/M 24.4%(control)→38.5%(薬剤1μM)→50.5%(薬剤2.5μM)

という表を載せており、ほとんどの細胞はG2/Mで停止しているが、30.6%の細胞はG1/S期で停止していると述べられています。この表からG1/S期に停止しているということが言えるのでしょうか？G2/M arrestを起こす薬剤であるということしか分からないのではないですか？よろしくお願いします。
　
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(無題) 削除/引用
No.2433-6 - 2008/12/05 (金) 09:01:32 - あの
G1/Sピーク>G1ピークに訂正します。

(無題) 削除/引用
No.2433-5 - 2008/12/05 (金) 08:37:24 - あの
ちょっと、質問の意味を取り違えていたようで訂正します。

Fig.1 をぱっとしか見てませんが、著者たちの解釈
Partially, 5'-NIO also arrested cell cycle in G1/S phase via the reduction of CDK4 and cyclin D1/D3 levels,,,

はたぶん間違っていて、質問の指摘が正しいと思います。少なくとも、時間経過に依存して、G1/Sピークが増加しないといけませんね。おおさんの指摘も正しいと思います。

さらに、＞G1/SかG2/Mかはそれぞれ、BrｄUとか、ｐ−Histone　H3とかで（PIと）２重染色をしてFlow　Cytometryするのが厳密だと思います。

２重染色をやっていない論文も多いようですが、サイエンス的には失格の場合が多いと思います。

(無題) 削除/引用
No.2433-4 - 2008/12/05 (金) 02:40:41 - おお
>[Re:3] あのさんは書きました :
> Partially, 5'-NIO also arrested cell cycle in G1/S phase via the reduction of CDK4 and cyclin D1/D3 levels,,,
>

結構怪しいですね。G1/S(実際はG1からSに入る手前)で
止まっていればSのポピュレーションは下がるはずですが。

それにG1とSのポピュレーションが減っているなら
CDK4 and cyclin D1/D3の発現は活性は下がっていても
おかしくないですし、、、、

ほかに根拠があるのでしょうか、、、

(無題) 削除/引用
No.2433-3 - 2008/12/04 (木) 13:58:48 - あの
Partially, 5'-NIO also arrested cell cycle in G1/S phase via the reduction of CDK4 and cyclin D1/D3 levels,,,

って要旨に書いてありますけど。

G1/SかG2/Mかはそれぞれ、BrｄUとか、ｐ−Histone　H3とかで（PIと）２重染色をしてFlow　Cytometryするのが厳密だと思います。やっていない論文も多いようですが。

(無題) 削除/引用
No.2433-2 - 2008/12/04 (木) 13:29:22 - おお
>[Re:1] 初心者さんは書きました :
> Soo-A Kim et al: 5'NIO induces G2/M cell cycle arrest

> G0/G1 52.7%(control)→40.1%(薬剤1μM)→21.4%(薬剤2.5μM)
> S 11.4%(control)→7.3%(薬剤1μM)→9.2%(薬剤2.5μM)
> G2/M 24.4%(control)→38.5%(薬剤1μM)→50.5%(薬剤2.5μM)
>
> という表を載せており、ほとんどの細胞はG2/Mで停止しているが、30.6%の細胞はG1/S期で停止していると述べられています。この表からG1/S期に停止しているということが言えるのでしょうか？

論文、薬剤をチェックしていませんので細かいことは
分かりませんが、表からだけでは"30.6%の細胞はG1/S期で停止"とは
いえないと思います。
G2/Mでとまり、そのほかのフローが代わらなければ、G1の細胞がヘリ
しばらくはSの細胞数は変わらないと思えませんか?なんかその
典型的な変化の仕方に見えます。
DNA合成をほかのアッセイでやっていて、合成が行われてない
とか時間経過などの実験があるなら、解釈はかわってきますが、、、、

G1/S期で停止というのは、実際はS期にはいると細胞周期をとめられ
ないのでG1からSに入る手前で止まるのが典型的です。したがって
Sにはいった10%ほどは、お示しになった表だけで語ると、止まって
ないようにみえます。


ちょっとまって、なんで全体で100%にならないの?
コンスタントに(薬剤加えないでも)細胞が死んでるの?
ま、実測値でそんなもんなんですかね。

細胞周期に関するある論文で。 削除/引用
No.2433-1 - 2008/12/04 (木) 10:30:46 - 初心者
Soo-A Kim et al: 5'NIO induces G2/M cell cycle arrest

我々の実験室で細胞周期に詳しい人が居りませんので、場違いかもしれませんが教えて下さい。
上記論文では癌細胞にG2/M arrestを起こす薬剤に関して書かれています。
その中で、

G0/G1 52.7%(control)→40.1%(薬剤1μM)→21.4%(薬剤2.5μM)
S 11.4%(control)→7.3%(薬剤1μM)→9.2%(薬剤2.5μM)
G2/M 24.4%(control)→38.5%(薬剤1μM)→50.5%(薬剤2.5μM)

という表を載せており、ほとんどの細胞はG2/Mで停止しているが、30.6%の細胞はG1/S期で停止していると述べられています。この表からG1/S期に停止しているということが言えるのでしょうか？G2/M arrestを起こす薬剤であるということしか分からないのではないですか？よろしくお願いします。
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