Bio Technical フォーラム

  • 書き込みがかなり増えてしまいサーバーの負荷が大きくなったので、新しいBioTechnicalフォーラムに移行してください。
  • 新しいトピックは新フォーラムでのみ立ち上げ可能です。レスは2009年2月15日までつけられますが、その後は、つけられません。

トピック一覧 | 研究留学ネットに戻る

最新のフォーラム | このフォーラム(readのみ) | ひとつ前のフォーラム(readのみ)

このスレッドをはてなブックマークに追加このスレッドをはてなブックマークに追加

1コロニーには1種類のplasmid? トピック削除
No.2352-TOPIC - 2008/11/18 (火) 02:30:26 - さぶろう
サブクローニング初心者です。
教科書的な質問で申し訳ないのですが、transformation後LBプレートにまいた際のコロニーは、1つのコロニーに1種類のみのplasmidが入っているものなのでしょうか?
 先日1コロニーからプラスミドを精製しPCRをかけたところ、目的のバンド以外に薄いnon-specific bandが数本認められたのですが、これはPCRおよびプライマーの問題と考えてよいのでしょうか?
 ちなみにこの精製したプラスミドのシークエンスはきれいに読めており、配列は目的の配列と一致していました。
 
- このトピックにメッセージを投稿する -



5件 ( 1 〜 5 )  前 | 次  1/ 1. /1


(無題) 削除/引用
No.2352-5 - 2008/11/23 (日) 19:54:51 - L
リニア と ニック入り という可能性があるんじゃないかと。
どのあたりに出たバンドかにもよりますが。

(無題) 削除/引用
No.2352-4 - 2008/11/18 (火) 22:23:01 - おお
>[Re:3] さぶろうさんは書きました :

> これは、1つのコロニー中に複数のプラスミドが入るということでしょうか?

トランスフォーメーション直後、一つの大腸菌に複数の種類のプラスミドが
存在する可能性です。

(無題) 削除/引用
No.2352-3 - 2008/11/18 (火) 20:57:32 - さぶろう
>シングルクローンからPCRレベルでヘテロに見える理由に
トランスフォーメションのとき、大腸菌に複数のプラスミド
がはいるという事実が挙げられます。

これは、1つのコロニー中に複数のプラスミドが入るということでしょうか?

(無題) 削除/引用
No.2352-2 - 2008/11/18 (火) 06:06:58 - おお
もし、複数のポジティブクローンで、同様にエクストラの
バンドが得られるなら、単なるPCRのノンスペの可能性が高いと思います。
それぞれのクローンが同じ割合で、ヘテロになっていると
いうのは考えにくいので。

そのエクストラバンドのサイズに何か心当りはありますか?
シングルクローンからPCRレベルでヘテロに見える理由に
トランスフォーメションのとき、大腸菌に複数のプラスミド
がはいるという事実が挙げられます。その後増殖していくうちに
一種類に収束するので、ミニプレップでは1種類として扱う
わけですが。

1コロニーには1種類のplasmid? 削除/引用
No.2352-1 - 2008/11/18 (火) 02:30:26 - さぶろう
サブクローニング初心者です。
教科書的な質問で申し訳ないのですが、transformation後LBプレートにまいた際のコロニーは、1つのコロニーに1種類のみのplasmidが入っているものなのでしょうか?
 先日1コロニーからプラスミドを精製しPCRをかけたところ、目的のバンド以外に薄いnon-specific bandが数本認められたのですが、これはPCRおよびプライマーの問題と考えてよいのでしょうか?
 ちなみにこの精製したプラスミドのシークエンスはきれいに読めており、配列は目的の配列と一致していました。

5件 ( 1 〜 5 )  前 | 次  1/ 1. /1


パスワードを入力してチェックした記事を チェックした記事を