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細胞の経時的処理について トピック削除
No.2297-TOPIC - 2008/11/11 (火) 15:26:00 - 茶
細胞に薬剤等を時間ごとに加えてmRNAレベル(RT-PCRで)を調べる実験を行っています。ちなみに付着性細胞を使っています。

方法としては、RNAを抽出するTRIzolまたはISOGENを使っている
のですが、その処理方法について最近気になる点があるので
教えてほしいのですが…

私の場合は、TRIzol処理する際にまず培地を除去しPBSをdishに注ぎ軽く
培地を洗ってからTRIzolをdishに流し込んでいます。
今のところ予想通りの結果が出ているのは良いのですが
培地を除去したらPBSで洗わず、すぐにTRIzolを流しこむほうが
いいのではないかと思っています。
私の周りに似た実験を行っている人がいないため、どのやり方が
スタンダードなのかも解りません。
もし、同じ様な実験をしている人がいれば教えてもらえないでしょうか?

また、私は最短で1hから3h程度の処理ですが、もっと短い処理
例えば数分から数十分の処理で反応を見ている人はどのように
サンプルを得ているのでしょうか?その点についても宜しくお願いします。
 
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私は洗いません 削除/引用
No.2297-3 - 2008/11/11 (火) 18:12:27 - Pumpkin
PBSによる洗浄の影響を実験的に確かめたわけではないのですが、その状態のmRNA動態を見たいので培地を吸引後に速やかに処理しています。

茶さんは、薬物による反応を見られているので、処理の方法を常に一定化できていれば、どちらでも差がないように思えますが。処理の影響がないと思われるpositiveな結果が出ているのですから。

処理時間が短い場合には、影響が大きくなることが予想されるので、直ちにセルを溶解させた方がよいように思われます。

どっちもいます。 削除/引用
No.2297-2 - 2008/11/11 (火) 17:21:13 - mom-a
PBSで洗っている人、洗わずにTRIZOLを入れる人、両方います。

洗う人の意見:培地中の血清のタンパクが入るのが嫌。
洗わない人の意見:なるべく早く処理したい、細胞が傷むのが嫌、細胞が剥がれると嫌、など。

タンパクのコンタミについては、TRIZOL精製で除去できれば問題ないかと思いますので、自分でやるなら洗わないかも…。

私は浮遊細胞でしかやっていないのですが、浮遊細胞の場合は、PBSでの洗浄はしない方がいいとマニュアルにありましたので、それに従っています。

細胞の経時的処理について 削除/引用
No.2297-1 - 2008/11/11 (火) 15:26:00 - 茶
細胞に薬剤等を時間ごとに加えてmRNAレベル(RT-PCRで)を調べる実験を行っています。ちなみに付着性細胞を使っています。

方法としては、RNAを抽出するTRIzolまたはISOGENを使っている
のですが、その処理方法について最近気になる点があるので
教えてほしいのですが…

私の場合は、TRIzol処理する際にまず培地を除去しPBSをdishに注ぎ軽く
培地を洗ってからTRIzolをdishに流し込んでいます。
今のところ予想通りの結果が出ているのは良いのですが
培地を除去したらPBSで洗わず、すぐにTRIzolを流しこむほうが
いいのではないかと思っています。
私の周りに似た実験を行っている人がいないため、どのやり方が
スタンダードなのかも解りません。
もし、同じ様な実験をしている人がいれば教えてもらえないでしょうか?

また、私は最短で1hから3h程度の処理ですが、もっと短い処理
例えば数分から数十分の処理で反応を見ている人はどのように
サンプルを得ているのでしょうか?その点についても宜しくお願いします。

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