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ISHのアンチセンスプローブって? トピック削除
No.2161-TOPIC - 2008/10/22 (水) 18:25:42 - 申し訳ない
大変お恥ずかしいのですが、すごく初歩的な質問(確認)をさせてください。
現在ISHの勉強をしているのですが、ISHに使用するアンチセンスプローブって、Genbankとかに登録されているmRNAの相補鎖の方の配列を使用するんですよね?
つまりは、ポリA尾部のある配列に相補的な配列、プライマーで言うとリバースプライマーの配列がある側の鎖ということでよろしいでしょうか?
なんだか、勉強していくうちのこんがらがってきてしまいました。
自分で調べろとおしかりをうけるかもしれませんが、自分で調べているうちにどつぼにはまってしまったので。。。。
実際にISHをやっておられる方に、肯定(否定?)して頂けるとすっきりすると思うのです。
よろしくお願いします。
 
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ISHのアンチセンスプローブって? 解決済み 削除/引用
No.2161-3 - 2008/10/22 (水) 18:50:21 - 申し訳ない
APさん

さっそくのレスありがとうございます!
おかげさまですっきりしました。
さらに勉強に励みます!

(無題) 削除/引用
No.2161-2 - 2008/10/22 (水) 18:42:27 - AP
そうです。
アンチセンスプローブは正確にはアンチセンス鎖プローブanti-sense strand probeですね。DNA, RNAにかぎらず、相補対をなす二者の鎖を区別するのにセンス鎖(sense strand)とアンチセンス鎖(anti-sense strand)という語を使うことがあります。

センス鎖は転写産物と同方向の配列、同じ配列(もちろんTはUで読み替えますが)になるほうで、タンパク質をコードする遺伝子ならmRNAと同じ配列のほうです。もともとsense strandというのは「意味をなす鎖」ということで、ORF、コドンのとれるmRNAと同じ配列だと覚えておけば混乱しないと思います。

アンチセンス鎖は、それと相補になるほうで、転写産物の鋳型になるほう、アンチコドンと同じ配列をもつほうです。

ISHのアンチセンスプローブって? 削除/引用
No.2161-1 - 2008/10/22 (水) 18:25:42 - 申し訳ない
大変お恥ずかしいのですが、すごく初歩的な質問(確認)をさせてください。
現在ISHの勉強をしているのですが、ISHに使用するアンチセンスプローブって、Genbankとかに登録されているmRNAの相補鎖の方の配列を使用するんですよね?
つまりは、ポリA尾部のある配列に相補的な配列、プライマーで言うとリバースプライマーの配列がある側の鎖ということでよろしいでしょうか?
なんだか、勉強していくうちのこんがらがってきてしまいました。
自分で調べろとおしかりをうけるかもしれませんが、自分で調べているうちにどつぼにはまってしまったので。。。。
実際にISHをやっておられる方に、肯定(否定?)して頂けるとすっきりすると思うのです。
よろしくお願いします。

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