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アレイ 削除/引用 No.2142-5 - 2008/10/20 (月) 16:39:36 - ema アレイもあります。

(無題) 削除/引用 No.2142-4 - 2008/10/20 (月) 13:49:47 - ~ HPLCがないのでしたら、 塩酸で煮て分解して、薄層クロマトで移動度で分けて、 スポット部分を薬さじでかきとってバッファーで抽出して、吸光光度計で定量する ということも可能かと。 10年以上昔の手法ですけど。

返信ありがとうございます 削除/引用 No.2142-3 - 2008/10/20 (月) 11:39:16 - 北の大地 通りすがりさん、素早いご回答ありがとうございます。 HPLCはデータの信頼性が高そうですが、うちでは ちょっと無理みたいですね… 5mC抗体での染色、反復配列を用いたPCRを検討したいと 思います。ありがとうございました。

(無題) 削除/引用 No.2142-2 - 2008/10/20 (月) 11:35:38 - 通りすがり よく使われる方法は塩基レベルまで切断してからHPLCなどでCと5mCの比率を測定する方法で、一番信頼性は高いですが設備などの点でできないラボが多いと思います。共同研究などで工学系のラボと一緒に行うのも一つの手です。 ただよく代わりに使われるのはdot blotでゲノムをスポットしていき 5mC抗体などで検出する方法でしょうか、あるいは最近だとLINEやcentromere付近のヘテロクロマチンなどのゲノム上の反復配列がゲノムの大部分のメチル化の量に比例していることから、これらのlocusのメチル化を通常のbisulfite→gene specificなprimerでのPCRを行う方法もとられます。

ゲノムのDNAメチル化の定量 削除/引用 No.2142-1 - 2008/10/20 (月) 11:27:43 - 北の大地 調べてもよくわからなかったので質問します。 細胞のゲノム全体のDNAメチル化を定量する方法って どんな方法があるのでしょうか？ ある遺伝子のDNAメチル化レベルを調べるのではなく、 細胞トータルのゲノムのDNAメチル化を定量したいと 考えています。 何か、キットとか実験手法とか、なんでもいいので 教えて下さい。

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