いつも勉強させていただいてます。
RT-PCRで依然はシングルバンドだったにもかかわらず、
同じ条件でPCRしているのに、スメアになり、増えなくなってしまいました。
詳しい症状としては、コームの部分が強く光り、そこから下に伸びるスメアになって白くなってしまいます。
何故このようなことが起こるのか、またその改善方法についてご教授いただけませんでしょうか?
アドバイスいただきたく思います。よろしくお願いします。
以下条件です。
PCRのキット:clontechのAdvantage 2 PCR kit
サイクル数:40サイクル(25〜30でも同じ症状、20だと何もなくなる)
ゲルは1.5%でやっていましたが、0.5%でも同じ症状。マーカーはきちんと流れている。
他の遺伝子や目的遺伝子の他の部分は増える。
Templateの作り直しや、Primerの買い替え、試薬についても変えたが同じ症状。
Primerはその部分を増やしたいので、配列を大幅に変えることができない。 |
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