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プラスミドpKT230の配列 トピック削除
No.2022-TOPIC - 2008/09/27 (土) 11:53:49 - N
broad host range vector pKT230の全配列を探しています。
Genbank等には登録されていないようです。

どこで配列を取得できるかご存知の方がいましたら教えて下さい。


referenceを見つけたのですが、古すぎてすぐには取れませんでした。
このrefernceを基にoriginの配列をつなぎ合わせて自分で全配列をgetするしかないのでしょうか、、、?
 
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(無題) 削除/引用
No.2022-5 - 2008/10/01 (水) 19:43:17 - N
>[Re:3] ~さんは書きました :
> ラボの冷凍庫で見つけたなどでしょうか?

そうです。


> 大事な部分は読んでおいた方が心配なく使えると思います。

確かにそうですね。
ありがとうございます。シークエンスにかけてみようと思います。

(無題) 削除/引用
No.2022-4 - 2008/09/30 (火) 14:25:14 - 後期中年者
全長の配列は登録されていないみたいですね。

http://seq.yeastgenome.org/vectordb/vector_descrip/NOTCOMPL/PKT230.SEQ.html

(無題) 削除/引用
No.2022-3 - 2008/09/30 (火) 13:39:58 - ~
ラボの冷凍庫で見つけたなどでしょうか?
実はラベルと中身が違っていたりしませんか?

昔、分与されたプラスミドで、作り方は間違っていないのでしょうけれども、
2コピーのインサートが入っていたことがありました。
(使用目的には問題なし)
全く異なるインサートが入っていたこともありました。
(PCRで回収できなくて、しばらくはまりました)

変異が入っているはずの発現ベクターを貰ったら変異が入っていなくて、
再度貰いなおしても、変異が入っていないものが来たこともありました。
(もう一回言うのはあきらめました)

>このrefernceを基にoriginの配列をつなぎ合わせて自分で全配列をgetするしかないのでしょうか、、、?
文献をもとにつなぎ合わせて配列を作っても、ライゲーション時に末端が削れているかは分かりませんし、
大事な部分は読んでおいた方が心配なく使えると思います。

(無題) 削除/引用
No.2022-2 - 2008/09/30 (火) 05:22:41 - おお
>[Re:1] Nさんは書きました :

> referenceを見つけたのですが、古すぎてすぐには取れませんでした。
> このrefernceを基にoriginの配列をつなぎ合わせて自分で全配列をgetするしかないのでしょうか、、、?

物によってはそういう情報しかないものもありますね。

プラスミドpKT230の配列 削除/引用
No.2022-1 - 2008/09/27 (土) 11:53:49 - N
broad host range vector pKT230の全配列を探しています。
Genbank等には登録されていないようです。

どこで配列を取得できるかご存知の方がいましたら教えて下さい。


referenceを見つけたのですが、古すぎてすぐには取れませんでした。
このrefernceを基にoriginの配列をつなぎ合わせて自分で全配列をgetするしかないのでしょうか、、、?

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