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(無題) 削除/引用 No.2018-5 - 2008/09/29 (月) 12:22:14 - Pumpkin Agilentのバイオアナライザーで計測して、強度が低ければ分解の可能性が強いと思いますが、RINがよくてrRNAの強度も強ければ分解の可能性は低いかもしれません。

(無題) 削除/引用 No.2018-4 - 2008/09/29 (月) 12:20:47 - Pumpkin 28Sと18Sの後にあるバンドというのは分解している可能性が高いです。私も似たような経験をし、この生物種（マーマルではありません）には新たなrRNAがあるのかもしれないなんて思いましたが、最初のグアニジンチオシアネート溶液の量を増やしてポリトロンなんかで丁寧にホモジナイズすると、これらのバンドは消えてrRNA ratioも改善されました。 AP様のおっしゃるように腸内細菌の23S、16Sの可能性もあるかもしれませんね。

(無題) 削除/引用 No.2018-3 - 2008/09/26 (金) 13:02:04 - techi APさん　ありがとうございます。 多糖類なんですね。 その方法で一度やってみます。 以前同じようなスレたっていたんですね。 気づかずに申し訳ないです。

(無題) 削除/引用 No.2018-2 - 2008/09/26 (金) 12:35:51 - AP 多糖類の沈殿でしょう。肝臓なんかだとグリコゲンが多いのが問題になりますが、大腸だとムコ多糖なんか多そうです。 多糖類を沈殿させないための、ProOH沈殿のステップの改良法があります。 http://www.kenkyuu.net/cgi-biotech2/biotechforum.cgi?mode=view;start=2;Code=784 Molecular Cloningでは、この沈殿法を採用していて、この有効な改良法が出てずいぶんたつのに、マニュアルがいまだに改訂されていないメーカーがあることに苦言を呈しています。 >28Sの下と18Sの下に1本ずつバンドが見られました。 わかりませんけど、腸内細菌由来？

大腸RNA 削除/引用 No.2018-1 - 2008/09/26 (金) 12:02:52 - techi いつも参考にさせていただいている大学院生です。 先日、マウスの組織からRNAを抽出したのですが、大腸のRNAがうまくとれません。 invitrogenのTrizolに液体窒素で固めた大腸を0.05g入れホモジネートし、クロロホルム処理、イソプロ処理を行い抽出しています。 大腸の場合、イソプロ処理後に出てくる沈殿が大きく、最終的にDEPC水に溶解する際も溶けずに残ってます。 そのまま、FAゲルでRNAを確認したところ28Sの下と18Sの下に1本ずつバンドが見られました。 大腸の内容物が多いからなのではと思っているのですが。 どなたか、イソプロ後の沈殿物と不可解なバンドが何なのかご存知のかたがいらっしゃいましたらご教授ください。よろしくお願いします。

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