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gatewayのプライマー作成 トピック削除
No.1901-TOPIC - 2008/09/06 (土) 04:49:01 - senbei
初めてゲートウェイシステムでコンストラクトを作成しています。
現在マニュアルを読んでいる状態ですが、プライマー作成の箇所をよんでいて少しわからないことがあります。

ネイティブで発現するときはShine-dalgarno配列と、コザック配列を挿入していますが、N末端にタグをつけるときにはそれらの配列は特に必要とも書いておりません。

現在GFPをN末端に入れて作成しようと思っているのですが、この場合上記のShine-dalgarno配列と、コザック配列は入れたほうがよいのでしょうか?
それとも、マニュアルに従いN末端にタグを入れる場合なのでこれらの配列は抜いてプライマーを作成したほうがよいのでしょうか?


私が始めてこのラボでゲートウェイシステムを使用するので、誰も相談する相手がおりません。
どうかよろしくお願いいたします。
 
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(無題) 削除/引用
No.1901-2 - 2008/09/06 (土) 13:56:23 - おお
そのベクターというよりは一般論でいいますと、N末にタグ用に予めGFPがついているベクターはGFPのN末にそれらの配列またはそれ相当の働きをするものがついています。ですからあなたのタンパクのN末につける必要はありませんし、つけない方がいいです。もし、自作でGFPをN末に持ってきてタグをつけようとするなら、GFPのN末にそれらを考慮しなければならないかもしれません。ただしShine-dalgarno配列は原核生物に必要な配列で、コザック配列は真核生物に必要な配列です。あなたの目的に合わせてどちらが必要か、両方が必要なのか考えてください。

gatewayのプライマー作成 削除/引用
No.1901-1 - 2008/09/06 (土) 04:49:01 - senbei
初めてゲートウェイシステムでコンストラクトを作成しています。
現在マニュアルを読んでいる状態ですが、プライマー作成の箇所をよんでいて少しわからないことがあります。

ネイティブで発現するときはShine-dalgarno配列と、コザック配列を挿入していますが、N末端にタグをつけるときにはそれらの配列は特に必要とも書いておりません。

現在GFPをN末端に入れて作成しようと思っているのですが、この場合上記のShine-dalgarno配列と、コザック配列は入れたほうがよいのでしょうか?
それとも、マニュアルに従いN末端にタグを入れる場合なのでこれらの配列は抜いてプライマーを作成したほうがよいのでしょうか?


私が始めてこのラボでゲートウェイシステムを使用するので、誰も相談する相手がおりません。
どうかよろしくお願いいたします。

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