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配列検索データベース トピック削除
No.1832-TOPIC - 2008/08/27 (水) 18:23:15 - せめど
DNASISについている機能のように、
塩基配列を1対1で比較することができる
検索データベースをご存知でしたら
教えてください。

例えば、ある論文で使われた検出プローブの配列が
既知のゲノム配列のどこにあるのか検索する、
といったような場合です。

よろしくお願い致します。
　
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(無題) 削除/引用
No.1832-2 - 2008/08/27 (水) 18:37:16 - sea
プローブ配列と比較したい配列の長さにもよると思いますが、
短い配列で手元に比較したい二つの配列があればClustalW,
ご質問のようにgenome wideに、ということであれば
genomic BLASTじゃないか、と思いますが。

配列検索データベース 削除/引用
No.1832-1 - 2008/08/27 (水) 18:23:15 - せめど
DNASISについている機能のように、
塩基配列を1対1で比較することができる
検索データベースをご存知でしたら
教えてください。

例えば、ある論文で使われた検出プローブの配列が
既知のゲノム配列のどこにあるのか検索する、
といったような場合です。

よろしくお願い致します。
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