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RNAの増幅 削除/引用 No.1826-2 - 2008/08/26 (火) 20:34:52 - ema 日常的にアレイをしているものです。 極めて実験的でないならメーカー推奨方法を使った方が良いかと思います。 アレイのプラットフォームはなんでしょうか？ほとんどがAmbionですが Affymetrixなら２回増幅でT７MEGScript(#1333)でやってますし、AgilentはMessageAmpII(#1751)Acegeneでは(#1752)Nimblegenでは(#1753)と言われました。 実験的でよいならMedibicのOvation Systemはお勧めです。 ソート細胞とマイクロダイセクションのカットでにたような量で解析しました。 ５０００細胞、、、細胞の大きさによりますがぎりぎりAgilent2100picoで検出かかるなら 問題なくできます。 検出限界以下のときはRNAの品質という点で、全体を増幅標識してしまうマイクロアレイで品質の悪いものを検出するのは解析上危険です。リスクをわかった上でそのまま進むなりRT-PCR でアバウト確証をもってからなりで考えてみてください。

マイクロアレイ時のRNA増幅 削除/引用 No.1826-1 - 2008/08/26 (火) 17:00:02 - ぬらりひょにあん まだ、本格始動しておりませんが、近い将来マイクロアレイで網羅的に差次的遺伝子発現の解析をおこないたいと考えています。 ですが、ターゲットとなる細胞の回収量が非常にすくなく、何度か回収をしてもおそらく回収量は5000個ほどが関の山ではないかと予想されます。 ですので、RNAを増幅してからマイクロアレイにかけようと予定しています。 実際に微量なRNAから出発して解析されている方がおられる方がおられれば、おすすめのRNA増幅キットをおしえていただければ幸いです。 お手数ですがよろしくお願いします。

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