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(無題) 削除/引用 No.1722-5 - 2008/08/06 (水) 18:18:38 - qq よかったですね。 アレイデータの信頼性は、depositerの責任もあるかもしれませんが、利用者側で、判断するしかないと思います。実際、欠損値だらけのアレイデータもGEOにタクサンあります。アレイデータのSOFTファイルの読み方も、お勉強してください。

(無題) 削除/引用 No.1722-4 - 2008/08/06 (水) 12:21:17 - 新参者です。。 >Aさん reviewで検索すると数千以上も出てきました。。 中々、特定の組織での発現プロファイルが論文化されてなかったりしますと何でやってないねん。。ってなります。ありがとうございます！ >qqさん ありがとうございます！！ こういうの使ってみたかったんです。 全然教えて頂いたところは知りませんでした。 幸運な事に、HSF1 nullマウスと野生型マウスとでheat shockして、発現差のある遺伝子に僕が期待していた遺伝子が含まれていました。 しかし予想外にHSF1 nullとでは差はあるものの、heat shockでは誘導されてこないようです。 とすると恒常的な遺伝子発現にHSF1が大事なのかも。。と思いました。 世界を広げて下さり、ありがとうございました！！ 使い方が分からない事もあると思いますので、その際にはどうかご教示ください、宜しくお願い致します。

(無題) 削除/引用 No.1722-3 - 2008/08/06 (水) 09:11:29 - qq NCBIのGEO datasetsから、"heat shock" (human|mouse)で50件ほどのアレイデータがあります。 そのデータの中に出典が出ています。 そこから、適当なアレイデータを丹念に選択してレコード番号を取得します。 そこで、GEO profilesに移り、GDSXXXX（<=record番号）を調べると、Heat-shockで変化するプロファイルがきっと見つかります。 右に表示されるサムネイルから、期待するプロファイルの項目を選択して、その上にあるProfile neighborをクリックすると、類似のプロファイルを持つ遺伝子がリストされます。

(無題) 削除/引用 No.1722-2 - 2008/08/05 (火) 22:42:02 - A こういう情報はReviewにまとめられていることが多いように思います。 「heat shock」+「review」で検索されました？

heat shockによる遺伝子発現の論文 削除/引用 No.1722-1 - 2008/08/05 (火) 22:17:44 - 新参者です。。 現在、細胞をheat shockしてもしかしたら、ある遺伝子が誘導されないかなあーと期待して実験を行っています。 それはさておき、heat shockを行って発現してくる遺伝子を網羅的に示した論文があるのではないか、と思い、論文検索をしています。 機能的解析はやってなくても、ある時期に誘導されてくる遺伝子だとか、ある薬剤によって誘導されてくる遺伝子とかっていうのは、そういった網羅的に調べた論文にそう書いてあったと書かれてあったり、聞いたことがあったりします。 論文の検索の仕方がいまいち、よく分かりません。 どうか、検索キーワードをどうするべきか教えて頂けないでしょうかn(_^_)n ほ乳類細胞をheat shockで誘導される遺伝子なんですが、、、。

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