現在、バイオインフォマティクスの実験を計画しています。
これまでの実験から、ある物質Ａで細胞を刺激すると５つの転写因子が活性化されることがわかりました。現在知りたいのは、これら転写因子の活性化にどのようなシグナル伝達経路が関係し、どういったクロストークがあるかということです。そこで、in silocoの情報（タンパク質ータンパク質インターラクション）を基に関係図を転写因子から上流にさかのぼって引いていけば、転写因子活性化のためのシグナル伝達経路とこれらのクロストークが予想できると考えています。また、運がよければ全ての転写因子活性化にに共通する分子が予想できると思っています。
残念ながら、こういったバイオインフォマティクスの実験を全くしたことがありません。そこでお伺いしたいのですが、こういった実験の場合、どういったソフトが必要なのでしょうか？または、インターネット上にフリーのソフトやＷｅｂが存在するのでしょうか？素人にも出来るようなことなのでしょうか？
バイオインフォマティクスの経験のある方、アドバイスいただけたら幸いです。 |
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