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ありがとうございます 削除/引用 No.1404-5 - 2008/06/24 (火) 08:10:40 - ららら ゲルシフト実験をしております。 以前に別のたんぱく質で蛍光ラベル（合成で入れてもらう）を試してはいるので、そちらが大丈夫なのは確認済なのですが何分お金の問題がありまして（涙）。うまくいかないかもしれない実験に最初から資金を投入する余裕がないのでこのような質問とぴをあげました。 とりあえずEtBrで染まるとのことですので、やってみます。ありがとうございました。

(無題) 削除/引用 No.1404-4 - 2008/06/23 (月) 11:14:02 - パンタ RNAの話ですが、 私は20塩基対のRNAをゲルシフトして、エチブロで染めたことありますが、一応シフトしたバンド見えましたよ（ポジコンだけでしたが、、）。 また、NEBからsiRNAとタンパク質の結合をゲルシフトで見るポジコンタンパク質とマーカーが販売されています。 http://www.neb.com/nebecomm/products_Intl/productM0310.asp DNAとRNAの染まり具合を同じと考えるなら、検出できそうです。ただ、結合力が弱かったりすると、検出できないかもしれません。

(無題) 削除/引用 No.1404-3 - 2008/06/23 (月) 09:10:19 - おお 染まるかどうかといえばおそらく染まるでしょう。ゲルシフトの検出で考えているのであれば実験系によりますが、APさんが指摘されているようにほかの検出方法がいいかと思います。ピアスなどもこの手の検出用キットをうってます。

(無題) 削除/引用 No.1404-2 - 2008/06/22 (日) 17:43:30 - AP Gel shift (Gel retardation ) assayをするということですか。 数百bpのプローブでもEtBrでは感度的にかなり厳しいでしょう。 Rocheから末端DIGラベルのプローブをanti-DIG-APで検出するGel shift assayのキットが出ています（non-RI Gel shift系はたぶん他にもあるかもしれませんが）。 末端蛍光ラベルも、1プローブ分子あたり1〜2分子の蛍光物質だと心許ない気がします。だめだったら、上記DIG systemと同様に、抗蛍光物質抗体-APで酵素反応による増幅、化学発光で検出するという手は使えるでしょう。

短いDNAの染色 削除/引用 No.1404-1 - 2008/06/22 (日) 16:53:20 - ららら 25塩基対のDNAの蛋白質との結合実験をアクリルアミドゲルを用いて行おうとしております。 ライセンスの関係でRIが使えません。蛍光ラベルを入れたものの購入も検討中ですが、このサイズのDNAはエチジウムブロマイドでも染色が可能かどなたかご存知でしょうか。

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