Bio Technical フォーラム

  • 書き込みがかなり増えてしまいサーバーの負荷が大きくなったので、新しいBioTechnicalフォーラムに移行してください。
  • 新しいトピックは新フォーラムでのみ立ち上げ可能です。レスは2009年2月15日までつけられますが、その後は、つけられません。

トピック一覧 | 研究留学ネットに戻る

最新のフォーラム | このフォーラム(readのみ) | ひとつ前のフォーラム(readのみ)

このスレッドをはてなブックマークに追加このスレッドをはてなブックマークに追加

ホモロジー検索 トピック削除
No.1271-TOPIC - 2008/06/06 (金) 04:42:15 - homology
特定のいくつかの種間でホモロジー検索をしたいのですが
データベースの使い方がよくわかりません。
縦に相同性の高い配列を種ごとに並べて表示したいのですが
どうしたらいいでしょうか。
初心者でよくわからない次第です。
よろしくお願いします。
 
- このトピックにメッセージを投稿する -



2件 ( 1 〜 2 )  前 | 次  1/ 1. /1


(無題) 削除/引用
No.1271-2 - 2008/06/06 (金) 07:43:14 - おお
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=homologene
ホモロジーンはみられましたか?同じグループに属しているのなら、アライメントされているものがみれます。で必要なものだけとりだして(不必要な物をはずして)しまえばどうでしょうか。ここのアライメントをマルチプルアライメント表示ようのソフトに持っていけるかどうか分かりませんが、手動でも何とかなるのではと思います。
あとは配列をマルチプルアライメントにほりこむかですね。この場合はインプットする遺伝子の数でアウトプットの正確性が決まりますので多くの情報をインプットしておいて、必要なものだけ取り出すのがいいかと思います。http://clustalw.ddbj.nig.ac.jp/top-j.html
clustalwとか有名です。

ホモロジー検索 削除/引用
No.1271-1 - 2008/06/06 (金) 04:42:15 - homology
特定のいくつかの種間でホモロジー検索をしたいのですが
データベースの使い方がよくわかりません。
縦に相同性の高い配列を種ごとに並べて表示したいのですが
どうしたらいいでしょうか。
初心者でよくわからない次第です。
よろしくお願いします。

2件 ( 1 〜 2 )  前 | 次  1/ 1. /1


パスワードを入力してチェックした記事を チェックした記事を