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(無題) 削除/引用 No.1235-8 - 2008/06/04 (水) 06:30:17 - おお >[Re:7] seaさんは書きました : > 私も読みながら、「そんなばかなー」なんて思いながら > Pubmed とensemblで見てみたら、確かに配列が公開されていない > みたいですね。 > なるほど無さそうですね。抗体が先で抗原の方は同定されてないか、複数あるので一遺伝子に絞り込めないのでしょうか。 この辺は詳しい人のコメントが欲しいところですね。

(無題) 削除/引用 No.1235-7 - 2008/06/03 (火) 15:58:34 - sea 私も読みながら、「そんなばかなー」なんて思いながら Pubmed とensemblで見てみたら、確かに配列が公開されていない みたいですね。 そこら辺にリンクがはってある論文を見てみると、 もともとNeuNというタンパクはA60というモノクローナル抗体を 作った人たちがその抗体が認識するマウスのタンパクに対して NeuNという名前をつけたのが始まりのようなので、要は まだ抗原が同定されていない、もしくは配列が公開されていない、 ということなんじゃないですかね。 おおさんが書かれたようにGeneにentryがあっても、 遺伝子とやたんぱく質として配列が同定されていない、という 例があるんですね、多分。 Geneの該当entryにRefSeqが載っておらず、その他のＤＢへの リンクもほとんどありませんからそのように解釈するしかないのかな、 と思います。 どこかで論文に配列が掲載されているもののGeneに配列が登録されて いない、ということはまずないと思うので、どうしても配列が欲しければ 自分でこのタンパクの配列でもシークエンスしないと ダメなんじゃないですかね。 ま、それくらいならほかの神経マーカーを選択したほうがましな気が しますが。

(無題) 削除/引用 No.1235-6 - 2008/06/03 (火) 15:08:49 - おお マウスですから配列はもうてに入れたと思いますが、、、あとはやるかどうか決心するだけと思いますが、、、、

(無題) 削除/引用 No.1235-5 - 2008/06/02 (月) 19:11:28 - NeuN ありがとうございます。 Gene type protein codingとなっているので、タンパク質だと思います。 もう少し粘ってみます。

(無題) 削除/引用 No.1235-4 - 2008/06/02 (月) 18:37:19 - いや〜 確かに全然見つからないですね。 NeuNで200ほど論文探しましたがほとんどで組織染色していました。 できないのかもしれないですね。 しかもエンザンブルでもひっかかってこなかったので、、NeuNってタンパクなんですよね？ 糖鎖とかじゃないですよね？ 神経の分化の程度を調べる目的でのマーカーということなら、別の遺伝子を調べた方がいいそうかもですね(^^;　お役に立てず。 。。。。

(無題) 削除/引用 No.1235-3 - 2008/06/02 (月) 17:45:13 - NeuN ありがとうございます。 種はマウスを探してます。 やっているものの、いまだにわからずじまいです。。

(無題) 削除/引用 No.1235-2 - 2008/06/02 (月) 04:39:25 - おお Neuna60 neuronal nuclear antigen A60 [ Mus musculus ] GeneID: 107516 updated 14-May-2008 Official Symbol Neuna60provided by MGI Official Full Name neuronal nuclear antigen A60provided by MGI Primary source MGI:1929613 Gene type protein coding Organism Mus musculus Also known as NeuN 上記の一番下の記述を見ていただければNeuNはNeuna60 (neuronal nuclear antigen A60)の名前がこのデーターベースで使われているのが分かると思います。 生物種を書いていらっしゃらないので、これを参照しデーターベース検索すればいいかと思います。 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?Db=gene&Cmd=ShowDetailView&TermToSearch=107516&ordinalpos=1&itool=EntrezSystem2.PEntrez.Gene.Gene_ResultsPanel.Gene_RVDocSum

NeuNの遺伝子配列 削除/引用 No.1235-1 - 2008/06/01 (日) 20:01:54 - NeuN いつも拝見させていただいてます。 神経細胞分化マーカーとして使用されているNeuNですが、 この度実験で、NeuNのmRNAレベルを調べたいと思っています。 ですが、 抗体を使用して発現の有無、発現量など見てる論文がほとんどでした。 mRNAをみているのは調べた限りありませんでした。 また、NeuNのcDNA配列もデータベースには探した限りありませんでした。 どなたかcDNA、genome配列を知っている方いませんか？？

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